Благодаря подземным комнатам, во многом напоминавшим те жилища, которые египтяне занимали при жизни, герзейские усыпальницы стали предтечами гробниц раннединастической эпохи. Помимо чисто утилитарных вещей, в могилы клали амулеты и прочие ритуальные предметы, многие из которых несли на себе изображения богов (в их первоначальной, животной форме). Некоторые ученые полагают, что именно представления герзейцев о загробной жизни положили начало культу Осириса и пышным погребальным церемониям династического Египта.
Одно время считалось, что переход от додинастической к династической культуре явился результатом настоящей революции, обусловленной открытием металлов и образованием новых социальных структур. Однако современные исследователи склонны полагать, что на самом деле подобные изменения стали закономерным следствием поэтапной технологической эволюции. В этот же период начало формироваться египетское письмо. Разнообразные узоры, украшавшие керамические изделия, со временем превратились в набор стандартных знаков, во многом напоминающих классические иероглифы. Эти знаки представляют собой комбинацию из пиктограмм и фонограмм (рисунков, отображающих звуки), что является главным принципом иероглифического письма. Схожие системы письма существуют и по сей день (к примеру, японская).
Около 3000 г. до н. э. состоялось массовое переселение людей из пустынных районов южного Египта. В результате в долине Нила появились новые, весьма обширные поселения. Заключительным актом додинастической эпохи стало объединение Верхнего и Нижнего Египта — хотя тут по-прежнему существует больше вопросов, чем ответов. До сих пор непонятно, кто кого тогда завоевал. Часть источников указывает на победу юга (культура Накады) над севером (культура Маади). Однако появившаяся в итоге социальная система оказалась гораздо больше похожа на северную, чем на южную. Некоторые ученые пытаются объяснить подобные противоречия с помощью теории смешения. По их мнению, Египет был вначале объединен под властью северных правителей, но затем правление перешло в руки южных царей, которые, тем не менее, сохранили систему, созданную их предшественниками. В соответствии с другой теорией южане сразу победили северян, однако переняли затем их культуру. Подобное развитие событий имело место и в правление Птолемеев. Это были греческие правители Египта, унаследовавшие страну после смерти Александра Великого. Тем не менее они приняли местную культуру. При жизни их называли фараонами, а затем хоронили в соответствии с египетскими обычаями.