Около 4500 г. до н. э. в истории додинастического Египта начался амратийский период, известный также как Накада I. Это название он получил по той причине, что подавляющее большинство стоянок данной эпохи датируется тем же временем, что и заселение Накады. Типичное для этого периода оформление керамики позволяет говорить о развивающейся, художественно совершенствующейся культуре. Если прежние изделия из глины украшали незамысловатыми узорами, то теперь на керамике появляются геометрические фигуры и изображения животных. Более разнообразными становятся и формы сосудов. Объясняется это как практическими, так и эстетическими целями. Не менее популярными были всевозможные декоративные вещицы, в частности фигурки так называемых «танцовщиц» (раскрашенные статуэтки женщин с поднятыми руками).
Однако самые серьезные изменения наблюдались в этот период в архитектуре. Найденные при раскопках могил глиняные модели домов напоминают прямоугольные здания эпохи Древнего царства. Создается впечатление, что идея индивидуальных жилищ, крупных поселений, а возможно, и городов зародилась около 4500 г. до н. э.
Около 4000 г. до н. э. в Накаде, Гиераконполе, Гебелейне и Абидосе возникли первые города-государства. Археологи называют этот период герзейским (или Накада II). Он значительно отличался от амратийского и характеризовался прежде всего ростом влияния северных народов на их южных соседей. Об этом свидетельствуют различные артефакты той эпохи — главным образом керамика. Слияние этих городов-государств привело впоследствии к появлению культуры поздней додинастической эпохи, известной как Накада III.
Разницу между герзейской и амратийской культурами можно проследить на примере той же керамики. Амратийские глиняные изделия носили чисто функциональный характер (даже если некоторые из них и покрывали рисунком из простых линий). Герзейские сосуды отличались большим разнообразием форм, а среди узоров стали преобладать сложные геометрические фигуры и сценки из жизни людей и животных, в частности страусов и ибисов. Поскольку эти представители животного мира практически не встречаются у берегов Нила, можно предположить, что герзейские племена охотились в местах, расположенных в непосредственной близости от пустыни. По мнению ученых, именно представители этих племен оставили нам в наследство первые изображения богов. Как правило, богов рисовали плывущими в лодках или несущими штандарты — предметы, отчасти напоминающие те, которые позднее символизировали различные провинции Египта. Не исключено, что подобные изображения носили всего лишь исторический характер. Но поскольку рисовали их на тех артефактах, которые клали затем в могилы умерших, можно предположить, что эти образы имели особый, сакральный смысл.