Специфические антитела к ВКЭ в сыворотке крови определяются в короткие сроки после укуса клещом у инфицированных, независимо от отсутствия или выраженности симптомов инфекции при последующих наблюдениях. У половины инфицированных вирусом людей без симптомов болезни антигенемия ВКЭ не сопровождается сероконверсией с выявлением противовирусных антител. Со временем титр противовирусных антител в сыворотках от лиц, у кого они выявляются, возрастает, однако титры антител у инаппарантных инфицированных ниже, чем у больных с менингеальной и очаговой формами инфекции. В конце наблюдений более частая сероконверсия и наиболее высокие титры антител обнаруживаются у тяжелых больных в очаговой форме.
Таким образом, инфекционные, иммуногенные и патогенные свойства штаммов вируса из территориального гетерогенного пула ВКЭ у инфицированных вирусом лиц проявляются вариабельно, и изменения этих свойств у инфицированных коррелируют между собой. Очевидно, значительная часть штаммов клещевого пула вирусной популяции инфекционна для человека. Однако не все, а только часть инфекционных штаммов обладают высокой иммуногенностью в человеческом организме и вызывают быстрое образование вирусоспецифических антител, и, в свою очередь, только незначительная часть высокоиммуногенных по экспрессии специфических антител штаммов вируса также обладают высокой нейропатогенностью.
Наиболее часто (в 54,7%) случаев вирус из образцов крови инфицированных может быть выделен в первые 1–4 дня после укуса клещами. На 5–10–й день после укуса вероятность выделения вируса из крови снижается – до 9,6% случаев, а на 11–20–й день снова возрастает – до 25,0%. По истечении 20 дней и более вирус выделяется снова с низкой частотой – в 6,3% случаев. Такая особенность изоляции вируса из крови инфицированных лиц во времени отражает волнообразный характер вирусемии. Следовательно, наблюдаемые в клинике случаи двухволновой лихорадки острого КЭ также могут быть ассоциированы с более выраженной двухволновой вирусемией в крови инфицированных. В острой вирусной инфекции проявление лихорадки – повышение температуры, боли и слабость – это результат процессов аутокринно–паракринной активации иммунокомпетентных клеток – натуральных киллеров, макрофагов, нейтрофилов, Т– и В–лимфоцитов – цитокиновыми медиаторами иммунитета (интерферонами, интерлейкинами) с участием ЦНС и является начальной стадией системной реакции организма на проникновение возбудителя инфекции – чужеродных вирусных антигенов. Очевидно, первая волна лихорадки КЭ связана с развитием первой волны висцеральной вирусемии с репликацией ВКЭ в лейкоцитах, подкожных, эпителиальных клетках и, наконец, взаимодействием вируса в крови с иммунной системой макроорганизма. Одновременно, как это следует из появления первых симптомов поражения нервной системы, можно предполагать, что вирус начинает реплицироваться также в клетках периферической нервной системы, распространяясь в организме гематогенным, лимфогенным и/или нейрогенным путем. Проникновение и репликация вируса в спинномозговых нервах, клетках спинного мозга и далее в клеточных структурах шейной, затылочной зон головного мозга проявляются в виде развивающихся менингеальных и иногда очаговых симптомов клещевого энцефалита. В том случае, если репликация вируса в нервной системе, в структурах мозга в пределах целостной структуры гематоэнцефалического барьера занимает достаточно длительное время, цитолиз инфицированных клеток и исполнительные механизмы клеточно–гуморального иммунитета могут в значительной мере ингибировать висцеральную инфекцию и подавить вирусемию в периферической крови. Новая волна подъема вирусемии в крови и соответствующая повторная лихорадка у пациента тогда могут быть связаны с нарушениями структуры гематоэнцефалического барьера в результате развития вирусной инфекции в тканях мозга. По–видимому, повреждение нативной структуры барьера и рост его проницаемости для вируса ассоциируются с значительными нарушениями тканевых структур мозга в результате интенсивной репликации вируса в них. В этом случае вирус, размножившийся в мозге в значительных концентрациях, снова попадает в кровь, интенсивно реплицируется в интактных клетках крови, вызывает новую волну вирусемии в крови и может снова усилить активацию иммуноцитов, индукцию плейотропных цитокинов и инициировать еще одну волну лихорадки с выраженным менингеальным синдромом.