Осенью 1941 г. во многих литовских городах и местечках всё еврейское население было фактически уничтожено. К зиме 1941 г. в Вильнюсе из 57 тыс. живших там евреев было истреблено около 40 тыс.
В Латвии, Риге, 4 июля 1941 г. латышские полицаи подожгли несколько синагог с согнанными туда 2 тыс. евреев. Несколько тысяч евреев погибло от рук местных полицаев при расстрелах в Бикерниекском лесу под Ригой. Около 27 тыс. евреев было расстреляно недалеко от железнодорожной станции Румбуле.
Вся еврейская община Лиепаи к февралю 1942 г. была расстреляна в дюнах на берегу Балтийского моря. Жертвы перед расстрелом должны были раздеться догола, после чего их подводили к свежевырытой яме. Молодых женщин латышские полицаи перед расстрелом насиловали. Палачи выстраивались в два ряда. В каждого человека стреляли двое: стоявшие полицаи — в голову, а те, кто стрелял с колена, — в левую половину груди. Маленьких детей палачи бросали во рвы еще живыми. Раненых добивали из пистолетов. В ямы, заполненные трупами, спрыгивали полицаи, сапогами и шестами распихивали тела, чтобы в могилу вошло побольше тел. Евреи Латвии были уничтожены в основном наемными убийцами из местного населения.
В Эстонии почти всех мужчин еврейской национальности эсэсовцы и их пособники из местных жителей расстреляли уже в первые недели оккупации. Остальных евреев заключили в концлагерь и к концу 1941 г. всех убили.
В Бессарабии несколько сот тысяч евреев, цыган, других групп населения были депортированы в концлагеря Приднестровья, где они были уничтожены. С 12 по 28 сентября 1941 г. на окраине г. Дубоссар эсесовцы при активном содействии румынских оккупационных властей расстреляли более 18 тыс. евреев.
В Могилёве (Белоруссия) гитлеровцами было уничтожено 20 тыс. евреев. В Белоруссии местное население не принимало участие в массовом уничтожении евреев, как это было в Украине, Прибалтике, Бессарабии. Дело в том, что гитлеровская пропаганда разжигала ненависть украинских националистов к евреям, призывая их мстить за убийство Петлюры евреем Шварцбардом. Гитлеровская пропаганда выставляла евреев перед украинским, прибалтийским, бессарабским населением как опору советской власти и призывала их к истреблению евреев. Это во многом удалось. В Белоруссии же немцы не смогли привлечь местное население к массовому истреблению евреев. Белорусы считали, что евреи такие же люди, как и они, что евреи не сделали ничего плохого и их не следует убивать. Белорусы сочувствовали евреям и жалели их. Они понимали, что за убийством евреев наступит их черед. Поэтому в Белоруссии не существовало истребительных отрядов из местного населения, хотя некоторые белорусы служили немцам и помогали им в уничтожении евреев и партизан.