В русском монастыре в 1894 г. был установлен самый большой на Афоне 13-тонный колокол, доставленный из России, звон которого слышен по всему юго-западному побережью Афона. А в XIX в. колокола монастыря считались самыми большими и во всей Греции.
Гордостью обители является монастырская библиотека, сильно пострадавшая во время пожара 1959 г., и несколько бесценных реликвий, среди которых честная глава святого Пантелеймона и десница святого Иоанна Русского. Он является одним из особо почитаемых святых в Греции, а рука его сохраняет до сих пор кожные покровы, удивляя своим нетлением. Основная часть мощей святого хранится в храме Святого Иоанна Русского на греческом острове Эвбея и о них еще рассказ впереди. Кроме этих святынь важно указать частицы Животворящего Креста Господня, главу преподобномученицы Параскевы, частицы мощей святого Иоанна Предтечи, святого Иосифа Об-ручника, апостола Фомы, преподобного Симеона Столпника и многих других божиих угодников. Здесь имеется драгоценный семисвечник, изготовленный из камня Гроба Господня.
Множество благодатных целительных святынь — частиц мощей — находится и во втором монастырском соборе во имя Покрова Пресвятыя Богородицы. Третьим значительным храмом здесь является церковь во имя Святителя Митрофана Воронежского чудотворца, а также монастырю принадлежит множество параклис, именуемых так по-славянски часовен. Не менее важно указать чудотворную икону Богоматери «Иерусалимская», что размещена над царскими вратами, древнюю икону святого великомученика и целителя Пантелеймона, иконы святого Иоанна Предтечи и священномученика Харалампия.
Важно также отметить святой источник у входа в Северный братский корпус, целительные воды которого помогли избавиться от недугов многим сотням людей. Один из исцелившихся украсил икону над родником драгоценной ризой, которая и сегодня радует верующих сим благодатным подношением.
Монастырь Святого Пантелеймона отмечен подвигами многих русских насельников, наиболее известный из которых — старец Силуан, скончавшийся в 1938 г., о котором следует сказать особо. Его литературные откровения о сущности христианской жизни, монашеского делания давно получили большую известность в мире и переведены на многие языки. «Монашество — это молитва за мир, — говорил старец, — настоящему монаху невозможно быть равнодушным к бедствиям в мире; нужно молиться, чтобы все народы Земли встали на спасительные стези покаяния, искали примирения с Богом…» Сорок шесть лет подвизался старец на Афоне, непрестанно творя слезную молитву за себя и род человеческий, и это величайшее духовное горение нашло путь к сердцам людей в его литературных писаниях. Русская православная церковь в 1988 г. причислила блаженного старца Силуана клику святых, и паломники совершают благоговейное поклонение честной главе старца, хранящейся в обители.