Директива Ставки конкретизировала задачи действующим в Восточной Пруссии фронтам: 3-му Белорусскому — сосредоточить основные силы на разгроме самой мощной хейльсбергской группировки противника, 1-му Прибалтийскому — ликвидировать земландскую группировку врага, одновременно обеспечивая оборону рубежей, занятых войсками 3-го Белорусского фронта вокруг Кенигсберга.
В ходе боевых действий Красной Армии в Великой Отечественной войне такая большая и сложная перегруппировка производилась впервые. Черняховскому предстояло отстоять перед Верховным Главнокомандующим ряд своих глубоко продуманных и обоснованных предложений. В это время Сталин с Антоновым выехали на Крымскую конференцию трех союзных держав — Советского Союза, США и Англии, — где уже решался вопрос о послевоенной судьбе территории Восточной Пруссии. Черняховского радовало, что это стало возможным во многом благодаря и успехам 3-го Белорусского фронта. Однако он отдавал себе ясный отчет, какие огромные трудности еще предстоит преодолеть вверенным ему войскам для завершения Восточно-Прусской операции.
Немецко-фашистское командование уже понимало, что война проиграна, но, тем не менее, прилагало отчаянные усилия, чтобы оттянуть катастрофу. Обстановка перед фронтом наших войск в Восточной Пруссии сильно осложнялась ввиду предстоящих крупных перегруппировок. Черняховский считал целесообразным провести всю операцию под единым командованием 3-го Белорусского фронта. Это, по его мнению, облегчило бы решение задачи по сосредоточению сил для массированного удара.
Однако его предложение было отклонено.
Нелегко было передавать соседнему фронту армии, которые он успел пополнить, подготовить к прорыву укрепленного района, трудно расставаться с командармами Людниковым, Белобородовым, Галицким. Предстояло принять новые, менее подготовленные армии, сработаться с их командованием, организовать управление и взаимодействие. Времени для этого явно не хватало.
Во исполнение директивы Генерального штаба Черняховский решил встречными ударами 5-й общевойсковой и 5-й гвардейской танковой армий отрезать группировку противника от моря и тем самым лишить ее возможности получить помощь извне. Это была чрезвычайно трудная задача, так как 5-я гвардейская танковая армия в тот момент по количеству боевых машин равнялась лишь танковой дивизии немцев, а численный состав дивизий армии Крылова в среднем не превышал трех тысяч человек. Немецко-фашистское командование в составе хейльсбергской группировки имело две танковые и одну моторизованную дивизии, в каждой — по сто и более танков. С учетом штурмовых орудий у противника было в общей сложности более шестисот бронеединиц и четырнадцать пехотных дивизий численностью более десяти тысяч солдат и офицеров каждая. Кроме того, гитлеровцы мобилизовали в фольксштурм всех мужчин, способных держать оружие.