Обращение депутатов с протестом против президентского указа поддерживал в Конституционном суде председатель Комитета Верховного Совета по законодательству Михаил Алексеевич Митюков. Представителем президента был заместитель главы правительства Сергей Шахрай. Еще недавно в Верховном Совете они заседали вместе. В ту пору Шахрай считался очень влиятельным, к нему прислушивались. Но не судьи во главе с Валерием Дмитриевичем Зорькиным. Иваненко побывал у него на приеме. Зорькин хотел утвердиться первым же постановлением Конституционного суда и ухватился за это дело.
Конституционный суд заседал 14 января 1992 года. Установил: конституция РСФСР «не предоставляет Президенту права образовывать министерства».
Конституционный суд постановил «По делу о проверке конституционности Указа Президента РСФСР от 19 декабря 1991 года № 289 «Об образовании Министерства безопасности и внутренних дел РСФСР»:
«Разделение и взаимное сдерживание служб государственной безопасности и внутренних дел обеспечивает конституционный демократический строй и является одной из гарантий против узурпации власти. Указ Президента противоречит ряду законов РСФСР, содержание которых обеспечивает соблюдение установленного в Российской Федерации разделения властей, создает систему сдержек и противовесов, направленных в конечном счете на охрану конституционных прав и свобод граждан, конституционного строя в целом…
Признать Указ Президента не соответствующим Конституции РСФСР… Данное постановление вступает в силу немедленно после его опубликования, является окончательным и обжалованию не подлежит».
Сергей Алмазов:
— Мы праздновали победу, обмыли ее. Но правильно говорили те, кто считал, что плетью обуха не перешибешь. Появился новый указ о создании теперь уже министерства безопасности и о назначении Виктора Павловича Баранникова министром. Тут уже спорить было бесполезно. На этом история, такая небольшая, комитета госбезопасности Российской Федерации завершилась.
Случилось то, что вообще-то не должно было случиться. После Беловежья все российские структуры поглотили союзные. И только Комитет государственной безопасности СССР поглотил российскую структуру. Дело в том, что когда происходило это поглощение, во главе российских ведомств стояли люди, российской властью же и назначенные, и потому пользовавшиеся полной поддержкой Ельцина и его команды. И все происходило по одному сценарию: мы — главные, и вопросы возникали только технического свойства, можно сказать, детали. А Виктор Валентинович Иваненко не был своим. Никогда. Значит, и отношения с Ельциным у него были достаточно сложные.