До 1478 г. главным конкурентом Банка Медичи в Лионе был банк Пацци. Его управляющим был Франческо Каппони; говорят, что у него на службе состояло шесть факторов. После того как Пацци устранились, самыми важными соперниками Медичи стали Маннелли и Каппони. В 1470 г. первый взял управляющим Бартоломео Буондельмонти и нанял всего трех факторов. После 1480 г. Нети ди Джино Каппони, очень способный человек, превратил свой банк в ведущий концерн. Лоренцо Спинелли подозревал его в двуличии, в том, что он радуется каждой неудаче Медичи и распространяет ложные слухи.
Смерть Лоренцо Великолепного 8 апреля 1492 г. стала тяжким ударом для лионского филиала, поскольку его сыну Пьеро, любителю борьбы и других видов спорта, недоставало ни политических, ни деловых способностей. Менее чем за два года на горизонте сгустились тучи. Карл VIII готовился вторгнуться в Италию и возродить претензии Анжуйской династии на неаполитанский трон. Из-за того что Пьеро ди Лоренцо отказался пропускать французскую армию через территорию Флоренции, в июне 1494 г. король приказал выслать из Франции посланников Пьеро и всех служащих лионского филиала Банка Медичи. Они переехали в Шамбери в Савойе, но репутация банка сильно пострадала. Еще один удар лионский филиал получил, когда Пьеро выгнали из Флоренции, а все его имущество конфисковали. По соглашению с управляющими имуществом Медичи власть в лионском филиале перешла к компании, состоявшей из Лоренцо ди Джованни Торнабуони, Козимо Сассетти и Лоренцо Спинелли. С самого начала работы возникло препятствие в виде отсутствия оборотного капитала; банк был зажат между кредиторами, которые требовали платы, и должниками, которые пользовались любыми формальностями для того, чтобы уклониться от исполнения своих обязательств. Судя по предварительному перечню, безнадежные долги составляли свыше 19 500 экю, не считая прочих долгов Пьеро ди Лоренцо и его брата, кардинала. Их общая задолженность намного превосходила их долю в капитале. Спинелли писал Лоренцо Торнабуони: «Как известно, люди уничтожают того, кто уже подавлен». Дело было плохо, а стало еще хуже.
После поражения Карла VIII Спинелли и Сассетти вернулись в Лион и попытались продолжать, но без оборотного капитала их компания не могла успешно вести дела. Последним ударом стала смерть Лоренцо Торнабуони, наступившая в августе 1497 г. Оставался единственный выход: ликвидация. Многим кредиторам, в том числе Филиппу де Коммину, так и не заплатили. Так лионский филиал разделил судьбу других отделений банка Медичи и пришел к бесславному концу.