На этом реформы в Малороссии не завершились. В 1775 году была разрушена Запорожская Сечь, поскольку это был беспокойный источник вольности. Уничтожение Сечи Потемкин тайным приказом поручил генералу Петру Текелею и князю Прозоровскому. Текелей должен был взять в осаду Сечь, а Прозоровский двинулся с многотысячным войском занять казацкие паланки (слобода с небольшим укреплением и казацким гарнизоном). На то время в Сечи, как и в паланках, было мало людей. Ничего не подозревая, запорожцы разошлись на хозяйские работы, на рыбалку, охоту. В это время Сечь, которая располагала только 20 пушками и не более 10 тысячами сечевиков, была взята в осаду огромным московским войском. Это было 4 июля 1775 года. Войско состояло из 8 полков конницы, 17 эскадронов пикинеров, 10 пехотных полков, 20 эскадронов гусар и 13 полков донских казаков. Всего более 40 тысяч солдат и офицеров. Три дня Текелей простоял вокруг Сечи, и когда ему прислали донесение, что князь Прозоровский занял все запорожские паланки, он послал гонца в кош и пригласил старшину к себе в гости. Кошевой атаман Кальнишевский собрал на совет куренных атаманов и спросил:
– Что будем делать, панове атаманы? Москаль в гости нас зовет. Пойдем или нет? Отдадим Сечь-мать москалю, или не отдадим?
Казаки сильно заволновались. Они были возмущены тем, что их украдкой и неожиданно взяли в осаду, нарушив все договоры и вольности. Поднялся страшный шум, кто-то в запальчивости выкрикивал:
– Как?! Предать присягу?.. Отнять наше кровное, то, за что мы, наши отцы и деды кровь проливали?.. Да пусть Текеля приведет еще столько войска, то мы всех их уничтожим, как мух передавим! Разве можно отдавать Сечь-мать, наше славное Запорожье за спасибо москалю?! Не будет этого никогда! Пока солнце светит – не будет!
Но рассудительная часть старшинства видела, что нечего и думать о том, чтобы можно было защититься от гораздо большей силы москалей. Кроме того, слышала она уже и о том, что такая же сила захватила все их паланки, где остались их жены, дети и добро. Поэтому они и не склонялись давать отпор москалям. К тому же и сечевой архимандрит Владимир Сокольский начал просить не проливать христианской крови, а с надеждою на бога покориться его воле. Таким способом еле успокоили запальчивых, и старшина с хлебом-солью отправилась к Текелею, надеясь, что покорностью завоюет снисхождение. Текелей принял их приветливо, но вскоре арестовал и отправил в Петербург. Кальнишеского заслали в Соловецкий монастырь и там его замуровали в каземате без окон и дверей, только с маленькой щелью, через которую подавали ему пищу. В этом каземате он пробыл 12 лет, после чего его перевели в другой каземат и разрешили изредка под караулом посещать церковь, но разговаривать с ним было запрещено. И только царь Александр I в 1801 году освободил его. Но он, уже слепой и слабый, не захотел оставить монастырь и, прожив там еще два года, умер 23 ноября 1803 года на 112 году своей жизни.