Проведенные аресты заставили Савинкова и штаб подпольной организации усилить конспирацию в работе и готовиться к военному перевороту, приуроченному, как ожидалось, к высадке крупных сил интервентов на Севере. Пока нет достоверных сведений, что действия СЗРС были синхронизированы с выступлением левых эсеров. Такое согласование, конечно же, могло иметь место со стороны антантовских «контактеров», под их влиянием. Но факт, что вооруженное выступление левых эсеров и СЗРС произошло в один и тот же день — 6 июля 1918 г. Предпринятые советскими властями экстренные меры не позволили заговорщикам осуществить свои планы.
Несмотря на полный разгром повстанцев и сил левых эсеров, совершение государственного переворота, арест председателя Совнаркома Ленина и его близких соратников готовила английская разведка. Историки британских спецслужб категорически отрицают «госзаказ» на свержение власти большевиков силами резидентуры MI.c-MI6 (политической разведки), действовавшей в Москве и Петрограде. Однако они не могут не признавать, что один из основных ее агентов — С. Рейли («ST-1») именно подготовкой переворота и занимался весь период нахождения в Советской России.
Чекистская технология раскрытия подготовки заговора до сегодняшнего времени дискутируется в отечественной и зарубежной исторической литературе, но конечный результат работы ВЧК очевиден. Крупнейшей на тот период преступной политической акции не произошло. В ноябре–декабре 1918 г. состоялся первый открытый судебный процесс, в ходе которого, и это совершенно правильно, упор был сделан на вмешательство иностранных дипломатических представителей во внутренние дела нашей страны. К сожалению, чекистам не удалось захватить агента «ST-1» — Рейли и его ближайших сотрудников. Наказание понесли несколько агентов иностранных разведок, а скрывшихся организаторов попытки переворота приговорили к высшей мере наказания заочно. Привести приговор в исполнение удалось только в 1925 г., когда в ходе оперативной игры ОГПУ С. Рейли был выведен на территорию СССР.
Следующий 1919 г. отмечен в истории ВЧК вскрытием и пресечением деятельности крупных подпольных организаций. Этот год считается пиковым, тяжелейшим для страны советов за весь период гражданской войны. В первые месяцы года белые армии рассчитывали объединенными силами начать наступление на Москву. Главный удар наносили с Востока армии адмирала Колчака, а вспомогательные — с Юга войска генерала Деникина и с Северо-Запада генерала Юденича. В случае приближения белых к советской столице, внутри страны должны были проявить свою активность подпольные организации, прежде всего наиболее разветвленная и многочисленная — «Национальный центр» (НЦ). С ней в контакте находилась и офицерская организация, названная «Добровольческой армией московского района» (ДАМР). Если первая являлась неким «мозговым» ядром, то вторая, располагая несколькими тысячами членов, реально могла захватить власть в Москве. Ее возглавляли и входили в состав штаба бывшие царские генералы и полковники, мобилизованные в Красную армию и занимавшие достаточно высокие посты в различных военных учреждениях. Практически в полном распоряжении штаба «ДАМР» находились три военных школы по подготовке советских командных кадров, полк железнодорожных войск, некоторые артиллерийские и стрелковые части, дислоцированные в Москве и ближайших пригородах столицы. Штаб организации сформировал ударные группы для захвата Кремля, вокзалов, телеграфа, телефонной и радиостанций. Планировалось подготовить взрыв нескольких мостов, чтобы не допустить переброски к городу войск, верных советской власти.