Штаб командования ССО состоит из пяти отделов: разведывательного, оперативного, тыла, связи и административного. В подчинении начальника штаба командования имеется штабная рота.
В центре подготовки сил специальных операций проводится базовая и специальная подготовка личного состава подразделений ССО, а также обучение на специальных курсах командного состава специальных подразделений видов вооруженных сил и других силовых структур. Общий срок подготовки личного состава подразделений ССО рассчитан на два с половиной года.
Пополнение личного состава ССО осуществляется на добровольной основе за счет выпускников военно-учебных заведений, а также офицеров и сержантов ВС Турции, прослуживших не более трех лет и успешно сдавших контрольные тесты.
Базовое обучение военнослужащих ССО включает прохождение четырнадцати учебных дисциплин: боевая психологическая подготовка; специальная подготовка «коммандос»; парашютная подготовка; ориентирование на местности, патрулирование и проникновение на военные объекты; выживание; защита и безопасность; ведение боя в ограниченном пространстве; разведка; обеспечение внутренней безопасности; подрывное дело; боевые действия в зимних условиях и боевая лыжная подготовка; водолазная подготовка; горная подготовка; изучение иностранных языков.
В соответствии со своей специализацией военнослужащие ССО в течение одного — девяти месяцев проходят дополнительное обучение на курсах в специальных учебных центрах США и ФРГ.
В состав ССО входят две бригады сил специальных операций. Руководство подразделениями бригады ССО осуществляет командир (бригадный генерал). Общее количество личного состава бригады — около 600 человек.
Организационно бригада состоит из двух групп сил специальных операций. Группа ССО в свою очередь состоит из четырех батальонов. Общая численность каждой группы — до 330 человек. В батальон ССО входят шесть разведывательно-диверсионных групп.
Численность личного состава каждой группы 12 человек. В группу входят два офицера (командир группы и его заместитель) и 10 сержантов (разведчик, оперативник, снайпер, гранатометчик, два санитара-инструктора, два связиста, два сапера).
Личный состав бригад ССО состоит только из кадровых офицеров и сержантов, прошедших специальную подготовку и находящихся на действительной военной службе. Все они владеют двумя и более иностранными языками и обучены агентурным методам работы. Находясь непосредственно в боевых подразделениях, они имеют право носить отличительный признак ССО центрального подчинения — красный берет.