Выборные кампании 1999 и 2000 годов для Семьи оказались тяжелыми – в отличие от 1996 года; на уничтожение ее репутации работал целый федеральный канал. Но Семье удалось не только выстоять, но и снова выиграть выборы. На этот раз ей повезло: в выборах не участвовал больной Ельцин, а бронебойного ресурса «Первого канала», который контролировал Борис Березовский, хватило, чтобы уничтожить всех конкурентов выбранного Семьей преемника.
Новый молодой президент Владимир Путин справился не только с владельцем обижавшего Семью канала, но и со своим другом Березовским. Федеральные телеканалы стали управляться Кремлем, а Семья – терять свое влияние.
Казалось бы, Путин гораздо меньше поддавался влиянию окружения. Но и вокруг нового президента создались свои круги влияния, как прежде Коржаков с Юмашевым влияли на Ельцина. Конкуренты за влияние Путина были разные, но объединяло их одно: все они стали близки ему еще тогда, когда он даже еще не мечтал о кабинете в Кремле. Самым близким доверенным лицом Путина стал новый медиамагнат Юрий Ковальчук. Ресурсов у него было гораздо больше, чем прежде у Березовского. Правда, он об этом старается никому не рассказывать. Он прекрасно чувствует время и даже (вместе со своим братом) задает ему тон.
Назначение Путина премьер-министром в фактическом статусе преемника не делало его автоматически следующим президентом России. Президентским выборам предшествовали парламентские, и сначала Кремль должен был выиграть их. С партией, которая представляла бы путинскую платформу избирателям и потом проводила в парламенте политику Кремля.
Партстроительством в интересах Путина занимался Березовский. Именно он придумал блок «Единство» и помог разгромить антипутинский союз Юрия Лужкова и Евгения Примакова. Тогда Березовский работал в связке с Семьей и был ее частью. Юмашев называет Березовского «совершенно фантастическим человеком». «Умный, талантливый, с блестящими идеями. Человек фонтанировал неожиданными комбинациями, и это было чаще всего не про деньги».
Думская кампания 1999 года и последующее избрание Владимира Путина в 2000-м – это последние выборы, в которых Семья принимала непосредственное участие. Если в 1996 году в переизбрание Ельцина на второй срок вложились все олигархи, то в 1999-м такой союз уже не был нужен. Бизнес не слишком опасался Лужкова с Примаковым, в отличие от Зюганова, и вполне допускал, что преемник Ельцина им проиграет.
Путин был назначен премьером в августе 1999 года – чуть больше чем за четыре месяца до думских выборов. Тогда его практически никто не знал. Без успешной думской кампании Семье нечего было и мечтать о том, чтобы ее ставленник выиграл президентские выборы. Присутствие в парламенте своей партии обосновывало легитимность претензий на власть новичка в политике, до сих пор не проявлявшего активности в публичном поле. Да и работать новому президенту с оппозиционным парламентом было бы некомфортно – нужно было создать задел для политического торга.