С начала 1880 года правительственные круги Российской империи стали проявлять к Новому Афону усиленный интерес как к форпосту империи на Черноморском побережье Кавказа. В 1888 году его «удостоил» своим посещением Александр III. В честь этого события на берегу моря вблизи пристани, на месте встречи царя с настоятелем монастыря, «осчастливленные» монахи построили часовню. Дорогу, по которой царь «соизволил» пройти пешком, — от церкви Симона Канонита до строящегося нагорного монастыря — позже засадили кипарисами и назвали «царской аллеей».
Вслед за царем Новый Афон начали посещать и сановники Российской империи. Постоянным посетителем монастыря стал наместник Кавказа великий князь Михаил, который счел нужным опекать его.
В 90-х годах XIX века Новый Афон превратился в крупнейший религиозный центр на Черноморском побережье Кавказа. Для рекламы своего монастыря монахи стали большими тиражами выпускать религиозную литературу. Вскоре сюда нескончаемой чередой потянулись богомольцы. Новоафонские монахи усердно выполняли возложенные на них царским правительством миссионерские обязанности. В частности, они построили школу для подготовки абхазских детей к религиозной деятельности. Но многие абхазы, учившиеся в ней, неожиданно для монахов становились не священниками, а… революционерами. Революционный путь избрали Нестор Лакоба, Василий Агрба, Игнатий Вардания и другие.
Согласно установленному в монастыре порядку, никто не имел права без разрешения настоятеля проживать на территории Нового Афона более трех дней. Здесь было две гостиницы. Двухэтажная гостиница, окна которой выходили на море, предназначалась для «чистой» публики. Здесь богатых туристов-паломников ожидали все удобства. А посетители другой, «простонародной», гостиницы должны были довольствоваться жесткими койками без постельного белья[36].
Обманутые монашеской пропагандой, стекавшиеся со всех концов России богомольцы были в монастырском хозяйстве почти даровой рабочей силой. Вместе с послушниками и окрестными крестьянами они обрабатывали монастырские земли; ежедневно на работу выходило около 300 человек. С каждым годом монастырь непомерно богател.
Строительство монастыря еще не было закончено, а ему уже принадлежали огромные земельные угодья — почти 3898 десятин.
Основные доходы монастырю приносили паломники, покупавшие различные «святые» реликвии и жертвовавшие на строительство храма и прочие его нужды большие суммы. Часть этих доходов отправлялась в Старый Афон.
Монахи широко развернули и коммерческую деятельность. Желая извлечь экономическую выгоду, они изготовляли вино на своем заводе, построенном в 1880 году