Исходя из этих находок, археологи заключили, что обитатели Санторина знали и систему мер и систему исчисления. Они добывали известь, строили сводчатые сооружения и расписывали стены фресками. У них процветало сельское хозяйство, а в ткачестве и гончарном искусстве они достигли совершенства.
Опираясь на эти заключения, Луи Фигуй в 1872 году выразил мнение, что платоновская Атлантида была островом в Эгейском архипелаге, потонувшим в результате геологической катастрофы, и что этим островом мог быть только Санторин, часть которого, безусловно, погрузилась в море, а оставшаяся была покрыта толстым слоем вулканической пемзы. Под этим слоем, по его предположению, погребены города и селения, точно так же как были засыпаны вулканическим пеплом Помпеи и Геркуланум во время извержения Везувия в 79 году нашей эры.
19 января 1909 года К. Т. Фрост опубликовал в газете «Таймс» свою гипотезу о том, что рассказ Платона об Атлантиде, по сути дела, приукрашенная и фантастическая версия гибели Минойской цивилизации на Крите — трагедии, запечатленной в записях египтян. Такое же предположение выдвинул в 1912 году и Д. А. Маккензи. В то же время американский географ Е. С. Балч, который вел раскопки на Крите, разработал и представил Американскому географическому обществу свою гипотезу. По мнению Балча, рассказ Платона, несмотря на множество противоречий, которые трудно примирить, сводится к тому, что Атлантида была островом, являвшимся центром могущественного государства. Платон, по его убеждению, имел в виду Крит и Крито-Минойскую державу. Балч утверждал, что Критская империя могла быть разгромлена около 1200 года до нашей эры афинянами и их союзниками, египтянами, и что легенда о Тезее и Минотавре не что иное, как мифическое повествование об этой войне. Гибель же Атлантиды в морской пучине он считает аллегорией гибели Критской империи и ее исчезновения как торгового и культурного центра, а Геракловы столпы, по его мнению, это лишь проливы между безымянными скалистыми островами Эгейского моря.
Версию о том, что Атлантида находилась когда-то в Средиземноморье, несколько позднее, в 1925 году, подержал и Ф. Бутавандт.
В 1947 году профессор Кумарис представил Греческому антропологическому обществу доклад, где он отнес гибель Атлантиды к разряду «местных катастроф», вызванных землетрясениями или наводнениями на Средиземноморье. Такой же точки зрения придерживался и знаменитый немецкий натуралист прошлого века Александр фон Гумбольдт. По словам Кумариса, эта катастрофа наверняка не ускользнула от внимания египетских жрецов и была ими описана со всяческими преувеличениями, особенно размах бедствия. А потом Платон дал «преувеличенное описание тех преувеличений о которых слышал», — рассказ о гибели Атлантиды рос как снежный ком, катящийся с горы.