В возрасте двух лет мальчик тяжело заболел. Страдал он то ли разновидностью эпилепсии, то ли эта болезнь его являлась последствием перенесенного менингита. По некоторым источникам эта неизлечимая болезнь позже унесла несколько жизней других детей этой семьи.
Местный врач, лечивший будущего основателя Опус Деи, считал ребенка безнадежным и предрекал ему всего несколько часов жизни. Родители мальчика, люди религиозные, повезли на перекладных больного мальчика из Барбастро в Торре-сьюдад, где над рекой, в старом ските, хранилась деревянная фигура черной Девы Марии. Мать Хосемарии, Долорес, прямо на руках поднесла больного мальчика к кормящей Деве Марии и молила ее на коленях об исцелении. На следующий день врач посетил семью Балагера и со скорбью в голосе спросил: «В котором часу умер мальчик?» И почему-то радостная мать неожиданно ответила доктору: «Он не только не умер, но даже играет во дворе с другими детишками!»
История чудесного исцеления мальчика стала, конечно же, известной и, как и всякая легенда о великих людях или событиях, передается из уст в уста, а также описана во всех официальных источниках Опус Деи. Знаменательное событие, поддерживаемое родителями Хосемарии и молвой, никогда не забывалось подрастающим ребенком и определило в будущем его дальнейшую судьбу. Он поступил в семинарию и с согласия отца закончил также еще и факультет права в Сарагосе.
Официальной датой возникновения Опус Деи считается 1928 год. Возможно, именно этого хотел сам Эскрива. 2 октября этого года, молясь в мадридской церкви, Хосемария Эскрива услышал Божий глас с призванием о создании Опус Деи. Бросившись в благодарности на колени, он поклялся выполнить Божий завет. С тех пор мысль эта не оставляла честолюбивого священника.
В 1932 году Эскрива жил со своей матерью, братом и сестрой в Мадриде в нужде и поэтому занимался преподаванием. С 1933 года на квартире, в которой жила семья, стали собираться первые приверженцы теории Хосемарии – в основном представители духовенства Мадрида. Позже Эскрива стал привлекать в свои ряды молодых образованных людей, которые встречались для ведения духовных разговоров в час полдника прямо в квартире, которую снимала мать. Мужчины разговаривали, а женщины – мать и сестра Хосемарии – только обслуживали присутствующих, не имея права участвовать в этих собраниях.
Позднее в одной из комнат исправительной колонии, арендованной благочестивыми монашками, помогающими преступникам становиться на путь истинный, начался новый этап для Эскрива. Он становится духовным отцом для трех студентов медицинского факультета, не забывая пополнять свои ряды и другими членами зарождающегося ордена.