27–28 декабря «Вояджер-2» выполнил так называемый научный маневр этапа перелета CRSMVR[58] с целью калибровки магнитометра и обзора небесной сферы УФ-спектрометром и инструментами для регистрации частиц. Маневр состоял из десяти оборотов вокруг оси рысканья +Y в течение пяти часов и 25 оборотов по крену на протяжении двенадцати часов. Последний из них закончился на 20 секунд раньше, чем ожидал компьютер. Аппарат ушел в защитный режим, последующий разворот для наблюдения Марса не состоялся. При воспроизведении 30 декабря записанной информации выяснилось, что потеряно четыре из двадцати часов научных данных.
2 февраля 1978 г. аппарат еще раз попал в защитный режим, случайно потеряв Канопус в самом конце сеанса связи – операторы этого не заметили. В следующем сеансе в тот же день командами с Земли «Вояджер-2» был возвращен в штатное положение и 8 февраля впервые отснял Юпитер и его спутники с расстояния 437 млн км. Проводились также тестовые наблюдения Марса и Сатурна.
25 февраля научная команда фотополяриметра обнаружила, что прибор на «Вояджере-2» самопроизвольно переключает фильтры. Колесо фильтров проигнорировало команду вернуться в исходное состояние, но неожиданно выяснилось, что ее выполнило застрявшее ранее колесо анализатора. При тестировании 2 и 14 марта прибор работал без замечаний, но колесо анализатора на всякий случай трогать не стали.
Успешным был и пятичасовой тест сканирующей платформы 7 марта, во время которого установленные на ней камеры, ИК-радиометр и фотополяриметр калибровались по мишени.
Еще в конце ноября 1977 г. на «Вояджере-2» отметили ухудшение характеристик твердотельного усилителя SSA в составе передатчика диапазона S, и его пришлось ограничить работой на низком уровне мощности. Но намного более серьезной оказалась новая проблема с радиокомплексом, с которой аппарат столкнулся весной 1978 г. на полпути к Юпитеру.
Из-за ошибки наземной группы управления команды на борт не поступали достаточно долго, и активизировался бортовой алгоритм защиты. 5 апреля, по истечении семи суток с момента приема последней команды с Земли, «Вояджер-2» инициировал переключение с основного командного приемника № 1, заподозрив его в неисправности, на запасной приемник № 2. «Вояджер» честно доложил о ситуации на Землю, но, к изумлению операторов, отказался реагировать на инструкции, адресуемые теперь приемнику № 2. Впечатление было такое, что он их просто не слышит.
Через двенадцать часов, в соответствии с логикой бортовой программы, «Вояджер-2» сменил приемник еще раз. Первый заработал, и в течение 30 минут станция слышала Землю. После этого телеметрия показала мощный скачок по питанию, предохранители сгорели и основной приемник был мертв!