Первоначально церковь состояла из центрального четверика и алтаря, рубленных из толстых бревен диаметром 30 - 32 сантиметра (четверик - в обло с остатком, алтарь - в лапу). Стены церкви внутри были протесаны «в лас», то есть стесаны под одну плоскость. Потолок был сделан из досок, уложенных в елку на шесть пролетов по пяти балкам; пол настлан из широких сосновых пластин. Кровли были тесовые двухслойные, с потоками на курицах. Ширина досок достигала 38 - 42 сантиметров при толщине 4 сантиметра.
В церкви имелись два дверных проема: один в западной, другой в северной стенах. Северный проем сохранился почти без переделок. Вполне вероятно, что с этих двух сторон постройка была окружена галереей, которую разобрали позднее. Сейчас у северной двери имеется небольшой тамбур, появившийся совсем недавно.
Ильинская церковь в деревне Ильина Гора (1689 - 1691 гг.). Реконструкция.
Несколько позднее, возможно около середины XVIII века, к церкви с западной стороны во всю ее ширину пристроили трапезную, рубленную также в обло, но из более толстых сосновых бревен (диаметром до 35 - 40 сантиметров). Ее пластинчатый потолок поддерживается одной поперечной балкой - матицей. Вдоль стен трапезной, как и самой церкви, тянулись широкие скамьи с резными подзорными досками. Перед иконостасом с обеих сторон стояли клиросы. Теперь от скамей и клиросов сохранились только врубки в полу и на стенах.
С появлением трапезной, вероятно, изменилась и галерея: была удлинена с северной стороны. К этому же времени следует отнести и перестройку иконостаса. Первоначально он был довольно прост и строг: в расписных тяблах стояли иконы, образующие сплошную живописную стену. После реконструкции характер иконостаса изменился. Тябла уступили место новой, рамной конструкции; появились резные и вызолоченные карнизы, колонки и другие барочные элементы; в нижнюю панель добавили новые иконы. В сравнительно недавнее время почти все старые иконы подновили: подкрасили фон яркой голубой краской.
Как уже указывалось, церковь сильно изменилась в результате исказивших ее переделок XIX - начала XX века. Но и в первоначальном своем виде, так же как в формах XVIII века, это сооружение не принадлежало к выдающимся памятникам древнерусского деревянного зодчества. Его композиция и формы не отличаются законченностью и совершенством. И все-таки постройка интересна тем, что среди клетских культовых сооружений, обнаруженных в области, является индивидуальным вариантом, не копирует известные образцы, а имеет свой неповторимый архитектурно-художественный облик.