В 1593 г. Порта развязала новую войну, на этот раз с Австрией. Вновь встал вопрос о создании европейской коалиции против Османской империи. Попытки папы Климента VIII возродить «Святую лигу» оказались безрезультатными. Не рассчитывая на помощь Запада, император Рудольф II (1576–1612) предпринял шаги с целью создания антитурецкого блока из стран Восточной и Юго-Восточной Европы, но ее достижению мешали не только противоречия между державами, но и территориально-политические притязания Габсбургов, а также жесткая контрреформационная линия, проводившаяся Рудольфом во владениях и подвластных австрийскому дому странах с православным и протестантским населением. Обращаясь к правительству России с просьбами о финансовых субсидиях на войну с османами, Тайный совет императора вовсе не стремился привлечь Россию в ряды антитурецкой коалиции. Поддержки не получили и стремления правителя Ирана (в 1603 г. шах возобновил войну с турками) координировать свои действия с европейскими противниками султана и с этой целью пославшего несколько посольств в страны Западной Европы. В качестве союзника в Вене и Риме охотно видели бы Польско-Литовское государство, где именно в 90-х гг. политика Контрреформации резко усилилась. Однако в своей основной массе польско-литовские магнаты выступал за прежний курс на сохранение мира с османами, а правительство пыталось прежде всего усилить собственные позиции в Молдавии и Трансильвании. В конечном итоге Австрии удалось вовлечь в союз только Трансильванию, Валахию и Молдавию.
Первоначально наемная армия Рудольфа II добилась определенных успехов. Валашский господарь Михай Храбрый в конце 1594 г. начал задунайский поход и дошел до Балканских гор. В сражениях против турок принимали участие болгарские и сербские гайдуки. В 1595 г. Михай с небольшими силами одержал блестящую победу у Тырговиште над османской армией. С помощью трансильванских и молдавских войск, а также больших отрядов украинских казаков, ему удалось освободить от турок всю Валахию. Однако для победоносной войны с султанской империей сил коалиции оказалось недостаточно, к тому же внутри нее возникли серьезные разногласия. В 1601 г. в результате заговора был убит Михай Храбрый. Не получавшие жалования наемники Рудольфа грабили Венгрию и Трансильванию, внушая населению не меньший ужас, чем турки и их союзники – крымские татары. Вспыхнувшее в 1604 г. антигабсбургское восстание в королевской Венгрии стало началом внутриполитического кризиса в центрально-европейских владениях Габсбургов, где протестантские круги стали выступать против официальной религиозной политики и в поддержку окончания войны. В 1606 г. был заключен Житваторокский мир, территориально восстанавливавший статус кво, но освобождавший Австрию от обязательства платить дань туркам. Впервые за длительную историю османо-габсбургской борьбы было заключено соглашение, содержавшее серьезные уступки Порты. «Долгая война» 1593–1606 гг. завершила период постоянной османской агрессии в Европе.