В этих сложных внутриполитических условиях, при полном параличе власти и угрозе гражданской войны правительство НФА обратилось за помощью к опытному политику Гейдару Алиеву. После многочисленных просьб 9 июня 1993 г. Гейдар Алиев прибыл в Баку. 13 июня 1993 г. он выехал в Гянджу и провел переговоры с Суретом Гусейновым. 15 июня 1993 г. Гейдар Алиев был избран председателем Верховного Совета Азербайджана. 24 июня 1993 г. решением Милли Меджлиса Гейдар Алиев был наделен полномочиями исполняющего обязанности президента, так как сбежавший из Баку Абульфаз Эльчибей не мог исполнять свои обязанности. Благодаря мудрой и дальновидной политике Гейдара Алиева Азербайджану удалось избежать гражданской войны. Была стабилизирована внутриполитическая обстановка, и начался процесс налаживания деятельности госорганов.
30 июня 1993 г. Сурет Гусейнов был назначен премьер-министром Азербайджана. 1 июля 1993 г. приказом и. о. министра обороны Азербайджана в/ч 709 была восстановлена как войсковая единица Вооруженных сил Азербайджана.
В постановлении Милли Меджлиса Азербайджана от 16 июля 1993 г. № 648 дана следующая оценка событий 4 июня 1993 г. в Гяндже: «Случившиеся в Гяндже 4 июня 1993 г. кровавые события являются результатом специально разработанной и спланированной политики президента Азербайджанской Республики Абульфаза Эльчибея и других высокопоставленных должностных лиц, грубым нарушением Конституции и законов Азербайджанской Республики со стороны этих лиц». Этим же постановлением ответственность за эти события была возложена на президента Абульфаза Эльчибея и тогдашнее руководство страны[191].
Гейдар Алиев дал такую оценку событиям 4 июня 1993 г. в Гяндже: «4 июня произошли события в Гяндже. Преступники пытались разоружить корпус Сурета Гусейнова, пытались его убить. Не вышло! Танки Сурета двинулись в Баку. Эльчибей понял, что проиграл, потому что офицеры армии и МВД отказывались воевать с Суретом. Народный фронт понял, что приходит конец и народ их просто растерзает. Тогда Эльчибей решил пригласить меня, чтобы я спас положение. Он звонил мне в Нахчыван, но я не брал трубку. Он снова звонил, но я не брал. 7 июня они из Баку прислали самолет. Я разговаривал по телефону с Эльчибеем и отказался приехать в Баку. 9 июня войска Сурета находились в 100 километрах от Баку. Его люди были оскорблены, говорили: «Если придем в Баку, будем вешать преступников на фонарях!» Эльчибей снова прислал за мной самолет, умолял прилететь. Я согласился.
Признаюсь, мне страшно было лететь в катастрофу, но я понимал, что должен лететь, ибо решалась судьба народа. Прилетел, и мы беседовали с Эльчибеем несколько часов. Он предложил мне пост премьер-министра, который все еще занимал его соратник Панах Гусейнов. Я отказался. Они все собрались у Эльчибея и слушали меня. Я высказал все, что думаю об их преступном правлении. Иса Гамбаров не выдержал и сказал: «Мы думали, вы нам дадите совет, а вы произнесли нам обвинительное заключение!» Так оно и было.