Исхаков, 1999а — Исхаков Д.М. Руководитель великих. Воин, поэт и мыслитель Кол-Шериф // Казань. 1999. № 5/6.
Исхаков, 2000 — Исхаков Д.М. Некоторые данные о средневековой этнической ситуации в юго-восточных районах Татарстана (XIV–XVI вв.) // Проблемы изучения истории заселения и образования населенных пунктов Альметьевского региона. Казань, 2000.
Исхаков, 2001 — Исхаков Д.М. О сибирских татарах // Соседи. 2001. № 6–7 (май-июнь).
Исхаков, 2001a — Исхаков Д.М. Родословные и эпические произведения как источник изучения истории сословий Улуса Джучи и татарских ханств // Материалы Международного научного семинара «Источниковедение истории Улуса Джучи (Золотой Орды). От Калки до Астрахани. 1223–1556» (23–26 июня 1998 г). Казань, 2001.
Исхаков, 20016 — Исхаков Д.М. Этнополитические и демографические процессы в XV–XX веках // Татары. М., 2001.
Исхаков, 2002 — Исхаков Д.М. К проблеме этнических и политических связей тюрок Западной Сибири и Волго-Уральского региона в XV в. // Тюркские народы. Материалы V Сибирского симпозиума «Культурное наследие народов Западной Сибири» (Тобольск, 9-11 декабря 2002 г). Тобольск; Омск, 2002.
Исхаков, 2002а — Исхаков Д.М. О методологических аспектах исследования проблемы становления сибирско-татарской этнической общности // Сибирские татары. Казань, 2002.
Исхаков, 2002б — Исхаков Д.М. О родословной хана Улуг-Мухаммеда // Тюркологический сборник — 2001. Золотая Орда и её наследие. М., 2002.
Исхаков, 2002в — Исхаков Д.М. Родословные и эпические произведения как источник изучения истории сословий Улуса Джучи и татарских ханств// Источниковедение истории Улуса Джучи (Золотой Орды). От Калки до Астрахани. 1223–1556. Казань, 2002.
Исхаков, 2003 — Исхаков Д.М. Некоторые итоги исследования этнополитической истории Сибирского ханства в XV–XVI вв. // Сулеймановские чтения-2002. Тезисы докладов и сообщений научно-практической конференции. Тюмень, 2003.
Исхаков, 2004 — Исхаков Д.М. Введение в этнополитическую историю сибирских татар // Сулеймановские чтения-2004. Материалы VII межрегиональной научно-практической конференции. Тюмень, 2004.
Исхаков, 2004а — Исхаков Д.М. Особенности исламизации восточных групп татар в XV–XVI вв. (Приуралье и Западная Сибирь) // Доклады международной конференции «Исламская культура в Волго-Уральском регионе» (Казань, 8-11 июня 2001 г). Istanbul, 2004.
Исхаков, 2004б — Исхаков Д.М. Тюрко-татарские государства XV–XVI вв. Казань, 2004.
Исхаков, 2006 — Исхаков Д.М. Введение в историю Сибирского ханства. Очерки. Казань, 2006.
Исхаков, 2006а