Исаак, однако, уже в 1616 году открыл собственную типографию, а в 1620 году стал печатником Лейденского университета. Он специализировался на восточных книгах, но через несколько лет продал дело Бонавентуре и Аврааму, которые, в свою очередь, были назначены университетскими печатниками – это почетное звание с тех пор оставалось в семье. Первым из современников, которого опубликовали Эльзевиры, был Гуго Гроций, чье Mare liberum, «Свободное море», увидело свет в 1609 году. Эта деятельность стала особенно важной для амстердамского филиала фирмы, открытого в 1638 году Луи III, сыном утрехтского книготорговца. Сын Бонавентуры Даниэль (1626—1680) вступил с ним в партнерство и, в то время как лейденская ветвь медленно приходила в упадок, вдохнул новую жизнь в старое имя и добился процветания фирмы. Декарт, Бэкон, Коменский, Паскаль, Мольер, Мильтон, Гоббс – вот лишь часть из выдающихся авторов, опубликованных амстердамскими Эльзевирами. Со смертью Даниэля в 1680 году амстердамская фирма зачахла; однако ее слава не умерла, как следует из издания Of the Conduct of the Understanding, «Поведения о взаимопонимании», Джона Локка 1794 года в двенадцатую долю листа, которое, хотя и опубликовано в Лондоне, как заявляется, «напечатано для Даниэля Эльзевира-младшего». Лейденский филиал просуществовал несколько дольше, но при сыне Авраама I Яне (1622—1661) и внуке Аврааме II (1653—1712) дело неуклонно шло под откос и сгинуло, бесславное и неоцененное.
Той отраслью книгопечатания, в которой преуспели голландцы – главные мореплаватели тогдашнего мира, было составление и издание атласов и карт. Сам термин «атлас» впервые использовал Румольд Меркатор, в 1595 году опубликовавший под этим названием карты своего более великого отца Герарда Меркатора (1512—1594). В 1604 году гравюры Меркатора были проданы Йоссе де Хондту, амстердамскому граверу и картографу; и с 1606 года до конца XVIII века атласы, изданные фирмой Хондта, разошлись по всей Европе. Главную конкуренцию им составляли атласы, издававшиеся другой амстердамской фирмой, основанной Виллемом Блау (1571—1638) и продолженной его сыновьями Яном и Корнелисом. Их Atlas Novus, «Новый атлас» (6 томов, 1634—1662), и Atlas Major, «Большой атлас» (11 томов, 1650—1662), также изданные на немецком, французском и испанском языках, представляли собой истинные шедевры географической науки, типографского мастерства и искусства гравера – сочетание, которое так и не удалось превзойти более утилитарной продукции современных картографических институтов.