Солдатам цель операции объяснили просто – контрреволюция в Чехословакии захватила власть, открыла границу с Западной Германией (ФРГ) и советские войска должны опередить германское вторжение. К тому же якобы возникла опасность ввода в ЧССР американских войск и войск других стран НАТО.
В результате такой идеологической обработки многие солдаты и офицеры были уверены, что их отправляют на войну. Для поднятия боевого духа участникам операции «Дунай» солдатский паёк был увеличен на 50 граммов масла, 200 граммов мяса и 200 граммов белого хлеба в сутки.
На расширенном заседании Политбюро ЦК КПСС 16 августа было принято решение о вторжении советских войск. Оно было одобрено на совещании руководителей стран Варшавского договора в Москве 18 августа. Было принято решение путём военного вмешательства сменить политическое руководство Чехословакии.
В этот же день, 18 августа, в кабинете министра обороны СССР маршала Гречко собрался руководящий состав Вооруженных сил, командующие армиями, которые должны были осуществить оккупацию Чехословакии.
О чём там шла речь, впоследствии рассказал командующий 38-ой армией генерал Майоров в книге "Вторжение. Чехословакия. 1968 г.".
"Собравшиеся долго ждали запаздывающего министра. Появившийся министр без предисловий объявил собравшимся:
– Я только что вернулся с заседания Политбюро. Принято решение на ввод войск стран Варшавского договора в Чехословакию. Это решение будет осуществлено, даже, если оно приведёт к третьей мировой войне.
Эти слова, как молотом, ударили собравшихся. Никто не предполагал, что ставки столь высоки.
Гречко продолжал:
– За исключением Румынии – она не в счёт – все дали согласие на эту акцию.
20 августа – В ночь с 20 на 21 августа на территорию Чехословакии вступили войска пяти государств – участников Варшавского Договора.
Так началось вторжение советских войск в Чехословакию.
Рев танковых моторов, грохот гусениц разбудил в это утро мирно спавших людей. Чехословацкая армия сопротивления не оказала. Так распорядилось её командование.
Однако потери были. В ходе вторжения с 21 августа по 20 октября 1968 года в результате враждебной акции чехословацких граждан, погибло 11 военнослужащих, 87 было ранено. С чехословацкой стороны погибло 94 и тяжело ранено 345 граждан.
В 7 часов утра 21 августа все чехословацкое руководство на двух бронетранспортёрах под конвоем десантников было доставлено в аэропорт и самолётом вывезено в Легницу (Польша), в штаб Северной группы войск. Оттуда их переправили в Закарпатье, а затем в Москву на переговоры с советскими лидерами.