Видео-вставки (короткие эпизоды в игре, на ход которых игрок повлиять не может) дают более полное представление о романтическом треугольнике между Ниобе, Морфеусом и Локом, что отчасти позволяет объяснить враждебность Лока в отношении Морфеуса, проявляющуюся на протяжении всего фильма. В ходе игры можно заметить некоторое напряжение в отношениях между этими тремя персонажами. Что касается Призрака, то в фильме он представляется фоновой фигурой и произносит всего несколько реплик, хотя его появление на экране воспринимается как подарок пользователям, обладающим игровым опытом с участием этого персонажа. Некоторые кинокритики выражали недовольство тем фактом, что в серии «Матрица: Революция» Ниобе вытесняет Морфеуса из центра повествования, как будто второстепенный персонаж вытеснил на периферию полновесного протагониста. На самом деле, наше восприятие Ниобе напрямую зависит от того, есть ли у нас опыт игры в Enter the Matrix. Тот, кто имеет такой опыт, возможно, провел сотни часов, управляя персонажем Ниобе, что несравнимо больше тех без малого четырех часов, которые Морфеус присутствует на экране. Упорная борьба за сохранение жизни персонажа и успешная реализация многочисленных игровых миссий создают более тесную эмоциональную связь игрока с незнакомым зрителям персонажем, который появляется только в нескольких сценах фильма.
Возможно, наиболее показательный случай «аддитивного понимания» имел место, когда все серии трилогии уже вышли в прокат. 26 мая 2005 года Морфеус, наставник Нео, был убит в игре The Matrix Online при попытке регенерации тела своего воспитанника, отданного машинам в конце «Матрицы: Революции». Чадвик дает следующий комментарий:
«Они хотели использовать в качестве исходного пункта что-то крайне важное, значимое и шокирующее в одно и то же время. Смерть Морфеуса полностью соответствовала этим критериям». [50]
Таким образом, важнейший сюжетный поворот произошел не в фильме, ориентированном на массовую аудиторию, а в игре, рассчитанной на сравнительно небольшое сообщество геймеров. Более того, даже многие участники игры не были свидетелями этой смерти, а узнали о ней, по слухам, от других игроков или из вторичных источников. В дальнейшем смерть Морфеуса использовалась при создании некоторых игровых миссий в рамках онлайн-вселенной «Матрицы».
Нил Янг из ЕА обеспокоен тем, что братья Вачовски могут растерять значительную часть своей аудитории, предъявляя к ней слишком высокие требования:
«Чем больше слоев имеется в вашем продукте, тем меньший сегмент рынка он охватывает. Вы вынуждаете людей уделять больше времени изучению вашего сообщения, и в этом заключается одна из ключевых особенностей трансмедийного сторителлинга… Если мы хотим осваивать мир и представлять его одновременно через различные медиа, возможно, следует выстраивать более последовательную репрезентацию.