На этот раз терпение Сергея лопнуло окончательно, и он написал заявление в партком, от которого все схватились за головы. В результате на следующий же день ему предложили выехать в Ташкент, на более чем скромную должность начальника аэроклуба. Кому-то из генералов это показалось спасением и для себя, и для Героя Советского Союза – одного из лучших летчиков-истребителей. Кто-то даже заметил: «Дурак! Уезжай немедленно! Мы же тебя спасаем!» И он уехал один, любя ее, но при этом не желая быть с ней. Щиров не хотел мириться с действительностью. Но именно такая безысходность привела его на отчаянный шаг.
В начале апреля 1949 года подполковник Щиров получил распоряжение прибыть в Главный штаб ВВС. Но он не хотел возвращаться в Москву, тем более предвидел свое позорное, как казалось, увольнение из армии и отлучение от неба. В общем, там ничего хорошего ему не предвещало, и он принимает решение перед отъездом заехать в Ленинакан, встретиться с друзьями, поговорить. А там видно будет. Но по дороге после длительных раздумий резко меняет свое первоначальное решение.
Ночью Щиров сходит с поезда, следовавшего в Ленинакан, и направляется к государственной границе с Турцией. Возникшая и ставшая навязчивой бредовая идея, при аресте все рассказать в компетентных органах, заслонила разум. И как назло никого не оказалось рядом, чтобы отговорить Сергея от безрассудного и страшного поступка.
Рано утром 7 апреля пограничный наряд обратил свое внимание на человека в кожаном реглане и авиационной фуражке у канала, впадающего в реку Аракс, в районе селения Беркашат Октемберянского района Армянской ССР. Первоначально пограничникам показалось, что вероятный нарушитель делал все, чтобы его заметили. Он стоял на виду и вел себя странно. Сначала перешел канал, а затем вернулся. Наряд принял его за проверяющего и решил задержать. Задержанный сопротивления не оказал, но заявил, что является неудачным перебежчиком, и просил не препятствовать его переходу в Турцию.
Щирова доставили в Ереван, где тут же допросили, а потом отправили в Москву в МГБ СССР. К слову сказать, из 28 предметов, изъятых у задержанного, 18 составляли награды: медаль «Золотая Звезда», два ордена Ленина, орден Красного Знамени, орден Кутузова 3-й степени, орден Александра Невского, орден Отечественной войны 1-й степени, орден Красной Звезды, югославский орден и медали. Возможно, Щиров надеялся на то, что его наградной «иконостас» станет тем самым убедительным доказательством его честности, а то, что он расскажет в Москве, приведет эмгэбэшников в шок. Возможно…