За время Крестовых походов существовало несколько государств иоаннитов (государство иоаннитов в Акконе со столицей в Акре было последним государством крестоносцев в Палестине после падения Иерусалима).
Поражение крестоносцев на Востоке
Во время Пятого крестового похода 1217-1221 гг. иоанниты участвовали в неудачной осаде крепости Тавор (77 башен), а во время похода на мамелюкский Египет - принимали участие в долгой осаде и взятии крепости Дамисты.
В 1230 г. иоанниты завязали контакты с ассасинами* - тайной мусульманской организацией-государством, образованной в конце XI века в Иране и имевшей крепости и замки в Сирии и Ливане.
{* Ассасины (от арабского - хашшишин) - тайная сектанская организация (орден) неоисмаилитов-низаритов, образовавшаяся в Иране в конце XI в. Руководство ассасинов практиковало как средство политической борьбы убийство своих противников. Центром ассасинов был замок Аламут (в Северо-Западном Иране), захваченный в 1090 г. Хасаном Саббахом, основателем этой организации. Учение ассасинов распространилось в Иране, Сирии и Ливане. Характерной его особенностью с середины XII в. стало обожествление имама, главы их организации. Конец существования ассасинов положило монгольское войско Хулагу-хана в 1256 г., а в Ливане и Сирии последний удар нанесли мамелюки в 1273 г.}
В августе 1244 г. Иерусалим был взят войсками египетского султана ас-Салиха. 17 октября 1244 г. объединенное войско Иерусалимского королевства было разбито при Харбшахе войсками египетского султана Бейбарса. Из 7000 рыцарей в живых осталось только 33 тамплиера, 3 тевтонца и 27 иоаннитов; около 800 рыцарей были взяты в плен. В 1247 г. египтяне захватили также часть Галилеи и город Аскалон, который защищали иоаннитские рыцари.
В 1265 г. султан Бейбарс взял Кесарию и Арсуф, в 1268 г. - Яффу, Антиохию и мощную крепость тевтонского ордена Монфор. В 1271 г. была взята крепость Крак де Шевалье в Сирии.
В 1270 г. состоялся последний Крестовый поход - восьмой. 17 июля войска крестоносцев, возглавляемые французским королем Людовиком IX, высадились в Тунисе, где король умер от лихорадки. Поход завершился безрезультатно, был подписан мир - крестоносцы не смогли переломить ситуацию в свою пользу.
В 1285 г. войска султана Бейбарса взяли Маргат, в 1287 - Латакию, в апреле 1289 г. - Триполи.
В 1291 г., несмотря на всю доблесть рыцарей Красного Креста (тамплиеров) и рыцарей Белого Креста (госпитальеров), сражавшихся бок о бок, Акра была потеряна перед лицом подавляющего численного превосходства мусульманских войск. Иерусалимское королевство прекратило свое существование, как и последние владения крестоносцев на Востоке.