Беспокойство вызывала не только нехватка техники, но и ненадежность личного состава. Авиаторы 1-го морского гидродивизиона на общем собрании выразили поддержку восставшим и отказались принимать участие в боевых действиях против них. Реакция командования была жесткой и незамедлительной. Реввоенсовет тут же издал приказ: «Ввиду разложения и полной небоеспособности 1-й гидродивизион расформировать. Красное знамя этого дивизиона передать Штабу Воздухофлота Балтийского моря». Но этим дело не ограничилось. Вскоре около сотни морских летчиков и наземных работников (то есть, почти весь персонал дивизиона) были арестованы. Дальнейшая судьба этих людей неизвестна.
Состав авиационной группировки, сосредоточенной против Кронштадта, был весьма пестрым. В нее входили разведчики «Фарман-30» и «Сопвич-полуторастоечный», истребители «Ньюпор-17», «-23», «-24», «Спад-7» и «Сопвич-Кэмел», а также гидропланы М-9, М-15, М-20, трофейные «Шорт-184» и «Фэйри-IIIB».
Сухопутные самолеты разместили на Комендантском аэродроме Петрограда, а гидроавиацию – на гидродроме у Гутуевского острова.
Приказом Реввоенсовета Республики все авиасилы в Петроградском районе были подчинена начальнику Штаба РККВФ А.В. Сергееву, а он, в свою очередь, – М.Н. Тухачевскому, назначенному руководителем операции по подавлению восстания.
Утром 6 марта «Сопвич» с Комендантского аэродрома впервые вылетел на Кронштадт. Экипаж произвел визуальную разведку и разбросал над крепостью 20 тысяч листовок. При посадке самолет из-за сильного ветра потерпел аварию, но летчики не пострадали. Командование, прежде всего, интересовала связь повстанцев с внешним миром. По этому поводу летнаб доложил, что никаких дорог или тропинок на льду Финского залива в сторону Финляндии не обнаружено.
7 марта дальнобойные орудия начали обстрел Кронштадта, а четыре гидросамолета сбросили на остров еще 30 тысяч листовок. При посадке на Комендантский аэродром разбился «Кэмел». Вечером того же дня планировалась групповая бомбардировка крепости, но из-за сильного снегопада полет отложили на утро.
8 марта вновь мела метель. Под ее прикрытием на Кронштадт двинулись атакующие цепи пехоты, но они были своевременно обнаружены и обстреляны береговой и корабельной артиллерией. Понеся значительные потери, штурмовые группы отступили от крепости. В этот же день советские самолеты сбросили первые бомбы на Кронштадт и линкоры, вмерзшие в лед Военной гавани острова. Всего в бомбардировке участвовало 10 машин, но группового налета не получилось. Аэропланы взлетали поодиночке и парами: первый стартовал в 13 часов, а последний уже после 17. Бомбометание, в основном, производилось по линкорам, причем, опасаясь зениток, бомбили с большой высоты (2000 – 4000 м) и не добились ни одного попадания. Всего было сброшено около 240 кг бомб. При возвращении два «Ньюпора» потерпели аварии, а один был разбит вдребезги.