Законодательно норма, разрешающая некоммерческим организациям применять УСН, предусмотрена Законом от 21.07.2005 N 101-ФЗ. В соответствии с редакцией пп. 14 п. 3 ст. 346.12 НК РФ некоммерческие организации, в том числе организации потребительской кооперации, осуществляющие свою деятельность в соответствии с Законом РФ от 19.06.1992 N 3085-1 «О потребительской кооперации (потребительских обществах, их союзах) в Российской Федерации», а также хозяйственные общества, единственными учредителями которых являются потребительские общества и их союзы, осуществляющие свою деятельность в соответствии с указанным Законом, с 1 января 2006 г. могут применять УСН.
Согласно пп. 15 п. 3 ст. 346.12 НК РФ не вправе применять УСН организации и индивидуальные предприниматели, средняя численность работников которых за налоговый (отчетный) период, определяемая в порядке, устанавливаемом Госкомстатом России, превышает 100 человек.
В соответствии с п. 4 ст. 346.12 НК РФ в случае превышения численности работников организации обязаны осуществить переход на общий режим налогообложения. Эта норма введена Законом от 21.07.2005 N 101-ФЗ.
Средняя численность работников определяется в соответствии с Порядком заполнения и представления унифицированных форм федерального государственного статистического наблюдения: N П-1 «Сведения о производстве и отгрузке товаров и услуг», N П-2 «Сведения об инвестициях», N П-3 «Сведения о финансовом состоянии организации», N П-4 «Сведения о численности, заработной плате и движении работников», N П-5(м) «Основные сведения о деятельности организации», утвержденных Постановлением Росстата от 03.11.2004 N 50.
Согласно пп. 16 п. 3 ст. 346.12 НК РФ не вправе применять упрощенную систему налогообложения организации, у которых остаточная стоимость основных средств и нематериальных активов, определяемая в соответствии с законодательством Российской Федерации о бухгалтерском учете, превышает 100 млн руб. В целях определения указанного ограничения должны учитываться основные средства и нематериальные активы, признаваемые амортизируемым имуществом в соответствии с гл. 25 НК РФ.
С 1 января 2008 года не могут применять УСН иностранные организации, состоящие на налоговом учете в России. Ранее это ограничение распространялось только на иностранные организации, имеющие на территории Российской Федерации филиалы, представительства и иные обособленные подразделения (подп. 18 п. 3 ст. 346.12 НК РФ). А иностранным организациям, владеющим недвижимостью в России, но не занимающимся бизнесом, «упрощенка» была доступна. При этом в соответствии с пунктом 2 статьи 346.11 НК РФ они имели право не платить налог на имущество.