«Необходимо серьезно относиться к вопросам собственности, – сказал Миллеру президент, – а то рот разинете, и не будет у вас не только «Сибура», но и других предприятий».
Точкой невозврата для «Сибура» стал конфликт вокруг компании «Пургаз», которую «Газпром» в благодатное время ельцинских реформ сплавил по цене двухкомнатной квартиры «Итере», а теперь задумал выкупить. Сделка требовала значительных расходов. И «Сибуру» предложили вернуть долги «Газпрому», для чего было принято решение продать часть газоперерабатывающих заводов. Первым к продаже определили крупнейший ГПЗ – Сургутский. Голдовский завод продал, но что до денег – их он «Газпрому» не отдал. И этим подписал собственный приговор.
«Сибуром» занялась Генеральная прокуратура России. Как писала пресса – по инициативе службы экономической безопасности «Газпрома». Присутствовало и другое мнение – о том, что Миллер согласовывает все шаги по спасению активов «Газпрома» с администрацией прези¬дента в лице первого заместителя ее главы Дмитрия Медведева, которого Путин назначил председателем совета директоров «Газпрома».
7 января 2002 года Генеральная прокуратура возбудила в отношении руководства «Сибура» уголовное дело по признакам преступления, предусмотренного статьей 201 УК РФ (злоупотребление служебными полномочиями). 8 января следователи Генпрокуратуры провели обыски в дочерних структурах «Газпрома», а на следующий день арестовали трех руководителей «Сибура», в том числе и Голдовского. Без лишних церемоний Голдовский был препровожден в камеру следственного изолятора. Аферисту быстро объяснили, что если он не вернет активы, которые так бесцеремонно присвоил, то проведет в тюрьме остаток своей короткой жизни. 18 января 2002 года Голдовскому было предъявлено обвинение по статье 201 УК РФ, а 31 января - по статье 160-й УК РФ - присвоение, хищение чужого имущества в крупных размерах. После короткой борьбы нефтегазовая мафия сложила оружие. Просидев девять месяцев в Бутырской тюрьме, Голдовский вышел на свободу только после возвращения «Газпрому» всего, «что нажито непосильным трудом»: «своей» нефтегазовой собственности. Бывший президент «Сибура» покинул страну, переехав в Австрию. В руках же Путина оказался наибольший на то время стратегический ресурс России.
Пример Якова Голдовского ярко продемонстрировал, что Владимир Путин без колебаний применил силу и беспощадно растоптал одного из миллиардеров, быстро выиграв войну «не по правилам», которую «по правилам» выиграть не было никакой надежды, даже после многолетней судебной волокиты. Не все тогда в России уделили этому факту надлежащее внимание.