Количество лекарств должно быть минимальным. Следуя принципу подобия, идеальным было бы в каждом случае подобрать одно-единственное лекарство, которое бы полностью соответствовало и симптому, н пораженному органу, н конституции больного. Хотя найти такое единственное лекарство практически не удается, назначение больше 3–4 лекарств в одном рецепте не может считаться правильным.
Каждое лекарство способно взаимодействовать с другим. Таких основных видов взаимодействия три: лекарства могут дополнять друг друга (синергическое действие); хорошо действовать вслед предыдущему; быть антидотом. Понятие «антидот» в гомеопатии отличается от такового в обычной медицине. Гомеопатическое лекарство-антидот снимает ухудшение, вызванное другим лекарством. Например, чрезмерная сухость слизистых оболочек, вызванная длительным приемом брионии, может быть снята алюминой, которая способна вызывать сухость слизистых оболочек сильнее, чем бриония. Универсальным антидотом всех гомеопатических лекарств является камфора.
Несовместимость двух препаратов означает отрицательный эффект при их сочетании в одном рецепте. Известна несовместимость апис и рус, кислот и змеиных ядов. Нежелательно совместное назначение лекарств, соответствующих одной ботанической группе.
В описаниях фармакологического действия лекарств («Materia medica»), как правило, указывается их взаимодействие.
Не рекомендуется в один рецепт включать несколько лекарств в низких делениях.
Если показанные лекарства несовместимы, то их предлагается принимать в разные дни. Точно так же по дням могут распределяться лекарства двух рецептов, например, при необходимости лечить два заболевания.
Сложен вопрос о длительности лечения гомеопатическими лекарствами. Естественно, чем острее симптомы и чем быстрее они сменяются, тем короче время приема лекарств в низких делениях. Врач должен представлять возможную динамику симптомов, учитывая характер и течение заболевания, а значит, и последовательность назначения лекарственных препаратов. Например, при острых лихорадочных заболеваниях (острые вирусные респираторные инфекции в начальной стадии с высокой лихорадкой и ознобом) назначают аконит. При наступлении следующей стадии (через несколько часов или через сутки) после прекращения озноба и появления катаральных явлений аконит сменяет бриония. При невозможности постоянного или достаточно частого наблюдения за больным аконит и бриония могут даваться в одном рецепте. Таким образом, рецепт или должен меняться соответственно изменениям симптомов, или должен учитывать возможность быстрого изменения симптомов, т. е. последующие лекарства могут быть выписаны в одном рецепте. Лечение заканчивается при выздоровлении больного (если речь идет об острых заболеваниях). При хронических заболеваниях, что на практике встречается значительно чаще, симптоматические лекарства в низких делениях отменяют при исчезновении симптомов или назначают их более редкими приемами. Лекарства фоновые (конституциональные) назначают на более длительные сроки, делая приемы более редкими и/или повышая деление лекарств.