Как правило, фрегаты имеют по две палубы и по две платформы, 11 - 15 водонепроницаемых переборок и второе днище на большей части длины корпуса. В междудонном пространстве размещаются топливные и масляные цистерны. Каждый из отсеков обычно оснащен автономной противопожарной и вентиляционной системами с вертикальным расположением трубопроводов, а также средствами наблюдения и контроля, передачи данных о состоянии отсека и распределении электроэнергии, при минимальном количестве отверстий в межотсечных переборках. Непотопляемость, как правило, обеспечивается при затоплении трех смежных отсеков. Исключение составляют корабли с небольшим водоизмещением, которые сохраняют непотопляемость при затоплении только двух отсеков. Для обеспечения плавания в высоких и низких широтах, а также в условиях применения оружия массового поражения количество иллюминаторов в надстройках резко сокращено, в корпусе они полностью отсутствуют. Улучшение мореходности достигается установкой фальшборта и волноломов, что уменьшает заливаемость размещенных перед надстройкой систем оружия. Кроме этого, большинство кораблей снабжено системой стабилизации качки, включающей бортовые управляемые рули и скуловые кили. Все это позволяет им действовать в океане и применять без снижения эффективности все системы оружия, а также осуществлять пополнение запасов на ходу при волнении моря до пяти баллов. Большинство современных кораблей могут поддерживать полный ход в условиях Северной Атлантики в среднем в течение 45% всего годового времени (зимой до 30%).
Большинство фрегатов имеют развитые надстройки, часто простирающиеся по ширине от борта до борта. Учитывая опыт англо-аргентинского конфликта из-за Фолклендских островов, их изготавливают из стали. Алюминиевые сплавы применяются лишь для отдельных частей труб и мачт. Правда, есть исключения, когда этим опытом пренебрегают. (Это лишний раз доказывает, что некоторые страны не верят в реальность возникновения военных конфликтов и им флот нужен прежде всего для внешнеполитических акций, а также обеспечения своей юрисдикции над спорными акваториями, островами и участками континентального шельфа.) Кормовая оконечность обычно занята взлетно-посадочной площадкой для вертолета, под которой иногда размещается устройство опускания буксируемых антенн гидроакустических станций. Характерной чертой современного фрегата является наличие ангара на один-два вертолета. В корпусе многих фрегатов находится цитадель, оборудованная фильт-ровентиляционными установками. В ней постоянно поддерживается избыточное давление. Есть также пост дезактивации оборудования и системы водяной завесы. Для уменьшения эффективной поверхности радиолокационного рассеяния в надстройках наиболее современных кораблей используются скругленные кромки, наклонные стенки (под углом 7-10° к вертикали). Все углы, включая бортовые кромки палубы, закруглены для уменьшения радиолокационной заметности. Снижение теплового поля достигается за счет применения фильтров, различных форм газоотводных патрубков. Чтобы повысить живучесть, наиболее важные помещения и часть надстроек на ряде кораблей имеют броневую защиту.