Менее удалась Шульмейстеру другая задача, выполнения которой требовал Наполеон, — слежка за королевой Луизой Прусской. Русский монарх восхищался этой красивой и безмерно униженной женщиной и был настроен к ней дружественно. Наполеону непременно хотелось ещё более унизить королеву, очернив её, по возможности, в глазах царя; и это грязное дело должен был проделать его главный шпион.
По иронии судьбы, в карьере Карла Шульмейстера в 1810 году наступил неожиданный поворот. В этом году состоялся «австрийский брак» Бонапарта с Марией-Луизой. Господство Наполеона над Веной, ради которого столько сделал Шульмейстер, увенчалось бракосочетанием юной герцогини Марии-Луизы с ненавистным победителем её отца. Новая императрица, прибыв в Париж, принесла с собой столь сильное австрийское влияния, что шпион вынужден был удалиться. Ему не забыли интриг перед Ульмом и Аустерлицем.
Шульмейстер удалился, но не в лагерь врагов Наполеона, как поступили бы многие его коллеги, как сделали Талейран и Фуше с меньшими на то основаниями. Шпион, по-видимому, был искренно признателен Наполеону за полученные богатства и поместья. Он продолжал оставаться рьяным контрабандистом и жил в свое удовольствие в Мейне, где гостеприимство и благотворительность снискали ему уважение земляков-эльзасцев.
Враждебность австрийцев не убывала вплоть до 1814 года. После Лейпцигской «битвы народов» и поражения французов Эльзас был наводнен союзниками, и полк австрийской артиллерии специально послали разрушить поместье Шульмейстера. Во время «Ста дней» он примкнул к Наполеону, хотя тот пять лет назад и отверг презрительно его услуги. После того как Наполеон был разбит при Ватерлоо, его бывшего шпиона арестовали одним из первых, и он спасся только тем, что заплатил огромный выкуп. Это сильно подорвало материальное положение Шульмейстера, восстанавливать которое пришлось уже не контрабандой, в чем он знал толк, а биржевыми спекуляциями, что для шпиона и контрабандиста оказалось слишком сложным.
Шульмейстер был разорен. Пять лет у него ушло на постепенное собирание богатства, десять лет он пользовался немалой властью, Он мог частично сохранить и то и другое, как это удалось большинству беспринципных бонапартистов; но судьба сбросила его в бездну нищеты, как только кончился «метеорический бег Империи». Ему суждено было прожить ещё почти четыре десятилетия (до 1853 года), — неимущим, но нельзя сказать что недовольным гражданином Франции, которому правительство разрешило содержать в Страсбурге табачную лавчонку.