Основную массу девиц было решено сосредоточить в публичных домах. ВПК сразу же определил правила работы этих заведений. Открывать их могли лишь женщины, причем в возрасте от 35 до 60 лет. Хозяйкам в обязанность вменялся контроль за чистотой помещения, организация медицинского освидетельствования проституток и ведение документации. Строго регламентировались и правила поведения обитательниц публичного дома. Девицам предписывалось более двух вместе на улице не появляться, причем одеты они должны были быть скромно. Находясь вне заведения, проститутки должны были «употреблять в возможно меньших количествах белила и румяна, равно пахучие помады, масла и духи».
Женщинам легкого поведения запрещалось прогуливаться в Пассаже, на Невском, Литейном, Владимирском и Вознесенском проспектах, а также на Большой и Малой Морской улице.
Четко определялся и порядок организации публичных домов. Располагаться они могли не ближе 150 м от церквей и учебных заведений, их окна должны были всегда закрывать занавеси, а в зале для танцев и комнатах девиц строго запрещалось вешать портреты высочайших особ. Проститутки раз в неделю подвергались врачебному освидетельствованию, при этом у каждой из них был индивидуальный набор гинекологических инструментов. Дважды в неделю девицы обязаны были посещать баню. В 70–80-х годах XIX века члены врачебно-полицейского комитета настаивали на медицинском осмотре посетителей публичных домов, рассчитывая тем самым приостановить распространение венерических болезней.
В 1868 году по решению Государственного совета было утверждено новое положение врачебно-полицейского комитета и определен его штат. В основе преобразования надзора лежало освидетельствование всех без исключения проституток в самом комитете, а не в больнице, полицейских домах, домах терпимости или квартирах одиночек, как было прежде. Освидетельствование возлагалось на особых врачей комитета.
Весь штат врачебно-полицейского комитета был разделен на две части – медицинскую и полицейскую. В состав медицинской части входили инспектор, восемь участковых врачей и три акушерки. Во главе полицейской части комитета находился член-распорядитель, в ведении которого было 20 смотрителей, или полицейских агентов. Участковые врачи были обязаны освидетельствовать состояние здоровья проституток, которые являлись для обследования в смотровые отделения.
Смотрители имели свои участки, где осуществляли надзор за женщинами «свободной нравственности», дающими основание подозревать их в проституции. В случае обнаружения несомненных улик их приглашали явиться в комитет для осуществления медицинского надзора. Кроме того, каждый смотритель на своем участке наблюдал за своевременной явкой проститутки на осмотры, а также за выполнением содержательницами домов терпимости всех врачебно-полицейских правил. В обязанности смотрителей входило и несение дежурства на главных улицах с целью пресечения бесчинства проституток.