Именно на основании жалоб новгородцев Великий Князь судил, сменил и наказал посадника и арестовал бояр, ибо имел право верховного суда над всеми, имел право сменять чиновников, объявив только их вину. При этом он выполнил в точности старинный обычай — аресты проводили не одни только его люди, но обязательно с участием новгородских приставов. Он увез осужденных посадника и его товарищей в Москву, но и это была старина: Владимир Мономах, Святослав Ольгович заточали на юг бояр новгородских, и после в договорах это право не было отнято у князей.
Иван не нарушил ни в чем старины, но новгородцы уже отвыкли от нее, поскольку в продолжение многих веков Великие Князья не пользовались своими правами.
Подобный шаг — аресты "сильных мира сего" и вынесение более-менее справедливых решений привели к тому, что в суд Московского князя поверили. А так как ждать приезда Ивана в Новгород было долго — судиться поехали на Москву. Тем самым было нарушено древнее новгородское правило "на низу новгородцев не судить".
Дальнейшее стало дело техники. Некоторые из жалобщиков и ответчиков пытаясь выиграть свои дела были готовы на многое. Несколько должностных лиц, в том числе вечевой дьяк, выдали себя за послов города и титуловали Ивана Третьего не господином, а государем. Когда об этом узнали в Новгороде, там произошли некоторые беспорядки в которых были убиты промосковски настроенные бояре. На вече было принято решение, что Великий Новгород признает Великого князя своим господином, но не государем. Это стало поводом для войны.
И причиной — тоже. Для христианской Руси того периода государь это тот, кто самовластно устанавливает законы и вершит суд. Господин таких прав не имеет.
Переметнуться от господина можно (это все еще норма), но от государя — уже нет.
Интересное наблюдение, говорящее о том, что в этот момент язычники уже сильно отличаются от остальных русичей. Сестрорецкие князья спокойно титуловали Московских "государями", но избегали термина "господин".
Зимой 1477 года московская армия окружила не готовый к обороне Новгород, в котором через неделю начался голод. 13 января 1478 года Господин Великий Новгород прекратил свое существование. Еще были бунты в 1480, 1481, 1484 и 1487 годах, но все решилось именно сейчас. Остававшиеся на свободе лидеры и наиболее активные сторонники литовской партии были арестованы и вывезены в Москву.
Интересна ситуация с Иваном Савелковым — его от репрессий буквально спас Игорь Пятый, добившийся чтобы наиболее активного сторонника Борецких "сослали" в Сестрорецкое княжество.