Согласно молве, сэр Фрэнсис использовал свои волшебные чары для обеспечения жителей Плимута новым источником питьевой воды: для этого он просто произнес какое-то одному ему известное заклинание над источником в Дартмуре и приказал воде следовать за ним до Плимута. Дрейк шел по дороге, а вслед за ним по обочине бежал водный поток. В другой легенде рассказывается о том, как Дрейк остругивал кусок дерева, сидя на утесе Плимут-Хоу. Каждая его стружка, падая в море, превращалась в боевой корабль с полным вооружением. И сегодня многие в Англии считают, что именно так их страна и стала великой морской державой!
А потом знаменитый мореплаватель влюбился в некую Элизабет Сайденхем — девушку из аристократической семьи. Однако ее титулованные родители вовсе не хотели родниться с пиратом, пусть даже и весьма удачливым. Делать было нечего, и Дрейк ушел в очередной поход, чтобы разбогатеть, взяв при этом со своей любимой слово, что она его непременно дождется. Сначала Элизабет ждала Дрейка, но минул год, потом второй, а от него все не было никаких вестей. Затем поползли слухи, что Дрейк и вовсе погиб. Родители не теряли времени даром и подыскали ей вполне приличную партию. Воля девушки постепенно слабела, и в конце концов она согласилась стать женой другого человека. Но в тот же миг о готовящейся свадьбе узнал Дрейк, хотя и был на другом конце света. Пират тотчас велел зарядить пушку и выстрелил ядром в небо. Только началась свадебная церемония, как к ногам невесты внезапно с неба упало пушечное ядро.
— Это знак от Дрейка! Он жив и скоро вернется! — закричала Элизабет и тут же отказалась от жениха.
В 1585 году Дрейк вернулся с моря, и она вышла за него замуж. И ныне легендарное «пушечное ядро» (метеорит размером с футбольный мяч) хранится в Кум Сайденхем-хаусе, и каждый может оценить как способности легендарного пирата, так и оригинальность самой легенды.
Несмотря на приписываемые ему волшебные чары, Дрейк в конце концов все же потерпел поражение от испанцев в Вест-Индии. Случилось это в 1595 году. В следующем же году он умер на борту своего корабля недалеко от Пуэрто-Белью (современный Пуэрто-Белло в Панаме). Хоронили Дрейка в море, привязав к его ногам два серебряных ядра. Доподлинно известно, что, когда известие о смерти знаменитого пирата достигло Испании, там несколько дней подряд шли народные гуляния и благодарственные молебны в церквах: столь радостна была для испанцев смерть Дрейка. Но и после смерти Дрейк не перестал творить чудеса во славу своего Отечества. Уже находясь при смерти, сэр Фрэнсис якобы распорядился о том, чтобы его любимый барабан, который он возил с собой по всему свету, после его смерти отправили в Бакленд-Эби в Девоншире.