Патриарх Алексий II в преддверии Собора направил Первоиерарху РПЦЗ митрополиту Лавру письмо с выражением поддержки усилий, «направленных на воссоединение с Церковью в Отечестве», подчеркнув, что «чем дальше будет уходить время, тем меньше Русская Зарубежная Церковь будет оставаться русской Поэтому нынешнее время, может быть, уже последнее для того, чтобы соединить в одной Церкви две ветви русского народа».
Но еще до начала Собора секретарь Синода РПЦЗ епископ Манхэттенский Гавриил (Чемодаков) в одном из интервью сказал: «Такое впечатление, что чаяния скорейшего объединения не оправдываются Желание достичь единства поскорее приводит к тому, что за счет этого страдают сами принципы, во имя которых начались эти переговоры. Верующие люди находят, что с нашей стороны было сделано больше уступок, чем с противоположной. Это не бухгалтерский подсчет «пунктов», это острое чувство, которое ими владеет».
Другой епископ, возглавляющий многочисленную епархию РПЦЗ в Украине, Агафангел Таврический и Одесский опубликовал заявление, в котором подчеркнул, что предшествующий Собору диалог убедительно свидетельствует, что нет никаких новых аргументов в пользу объединения РПЦЗ и РПЦ МП, кроме численного состава, имущественного положения и положительного отношения к объединению нынешних властей России По мнению епископа Агафангела, следовало сначала договориться о принятии и утверждении обеими сторонами основных принципов, на которых может быть построено единство Русской Православной Церкви.
Итак, отношение к объединению в среде РПЦЗ было явно неоднозначным.
Собор открылся 7 мая 2006 г На первом заседании митрополит Лавр подчеркнул, что речь идет не о «соединении» или «слиянии», а о примирении и взаимном признании друг друга и об установлении евхаристического общения «при сохранении нашей административной самостоятельности» Митрополит Лавр заявил, что РПЦЗ не собирается отступать от своих принципиальных позиций, в частности, в вопросе неприятия экуменизма.
Возражений объединяться на первом заседании не прозвучало Официальные протесты от Леснинского Свято-Богородицкого монастыря во Франции и послание Общества ревнителей памяти митрополита Антония (Храповицкого), подписанное 1200 прихожанами РПЦЗ, оглашены не были.
Особого внимания заслуживает доклад архиепископа Берлинского и Германского Марка, в котором он признал ошибочной деятельность Архиерейского Синода РПЦЗ по открытию параллельных епархий и созданию иерархии в России в 1990-е гг. Через два дня в работе Собора обозначился существенный перелом – после доклада священника Виктора Доброва о текущей экуменической деятельности РПЦ МП В процессе дальнейшей работы делегаты были ознакомлены с содержанием выработанного на встречах согласительных комиссий РПЦЗ и РПЦ МП «Акта о каноническом общении».