Параллельно с существованием Морского министерства флотом стали пытаться руководить и различные «демократические» органы — комитеты флотов и флотилий, во многих из которых доминирующую роль играли члены партии большевиков. Наиболее активно революционные процессы шли на Балтийском флоте, где с апреля начал действовать Центральный комитет Балтийского флота — Центробалт. Приказы и решения комитетов очень часто шли вразрез с политикой Временного правительства. Подобное положение быстро привело к полной дезорганизации флота. Причем жертвами анархии стали прежде всего офицеры, стремившиеся просто выполнить свой долг.
Также развалу флота в значительной мере способствовали приказы Временного правительства, направленные якобы на «демократизацию» вооруженных сил, а реально способствовавшие полному подрыву их боеготовности. Речь идет прежде всего об отмене титулования офицеров и снятии ограничений в правах нижних чинов флота (Приказ по Флоту и Морскому ведомству № 5 от 5 марта 1917 г.), приказе об отмене погон и ряде других. Опьяненные неожиданно свалившейся на них свободой и постоянно подстрекаемые к выступлениям против существующей власти агитаторами различных партий матросы обрушили свой гнев прежде всего на тех, кто для них эту власть олицетворял, — на своих командиров. (О причинах подобных действий см. ниже.)
Пока речь пойдет о том, в каком положении находились офицеры флота в период Февральской революции 1917 г., во время Октябрьского переворота 1917 г. и в первое время после него.
Трагические события начались на Балтийском флоте 28 февраля 1917 г. Именно в этот день был убит командир крейсера «Аврора» капитан 1-го ранга М.И. Никольский. Он призывал к порядку матросов, стихийно собравшихся на очередной митинг, и именно командиру будущего «символа революции» довелось стать ее первой жертвой среди моряков. В тот же день были убиты арестованные накануне командир 2-го Балтийского флотского экипажа генерал-майор А.К. Гирс и его помощник полковник А.Ф. Павлов. Эти три офицера стали первыми в длинном скорбном списке моряков, погибших в годы русской Смуты.
Далее кровавая волна охватила базы Балтийского флота — Кронштадт и Гельсингфорс (совр. Хельсинки). В Кронштадте толпа матросов и солдат убила главного командира Кронштадтского порта, героя Порт-Артура адмирала Р.Н. Вирена, а труп его бросила в овраг. 3 марта был убит командир 2-й бригады линейных кораблей контр-адмирал А.К. Небольсин, на следующий день та же участь постигла и командующего Балтийским флотом вице-адмирала А.И. Непенина. От рук взбунтовавшихся матросов пали также комендант Свеаборгского порта генерал-лейтенант флота В.Н. Протопопов, командир 1-го флотского экипажа Н.В. Стронский, командир линейного корабля «Император Александр II» Н.И. Повалишин, командиры учебных кораблей «Африка», «Верный», «Океан» и других. В итоге жертвами событий 1–4 марта 1917 г. стали 95 человек (впрочем, численные данные о жертвах несколько различаются в разных источниках). В Гельсингфорсе погибло 45 человек, в Кронштадте — 40, Ревеле — 5, Петрограде — 4. Пропали без вести 11 человек и покончили жизнь самоубийством — 4, также погибли более 20 кондукторов. Со стороны восставших погибли семь человек. Более того, если погибших матросов с почестями похоронили на Марсовом поле как «жертв революции», то трупы офицеров, находившиеся в моргах, подвергались глумлению и даже не сразу выдавались родственникам. За несколько дней собственными матросами на одной только Балтике было уничтожено такое число офицеров, которое равнялось половине от погибших на всех театрах войны с 1914 по 1917 г.!..