В чем причина такой поистине звериной жестокости, с которой нижние чины расправлялись с теми, с кем еще недавно они вместе шли в бой? Капитан 2 ранга Императорского флота и видный деятель ВМФ СССР В.А. Белли свидетельствовал: «Значительно больше эксцессов происходило в Кронштадте. Причин к тому полагаю две. Во-первых, были освобождены из тюрем заключенные до революции матросы, активно связанные с революционным движением, а кроме них и различного рода уголовники. Во-вторых, ужасный режим, созданный в Кронштадте главным командиром адмиралом Р.И. Виреном, еще усилившийся во время войны, вызвал в матросах после революции желание отомстить своим угнетателям». Также можно отметить, что наибольшее количество убийств происходило на кораблях, которые меньше всего участвовали в военных действиях и больше времени провели на базах, чем в боевых походах, в частности, на бригадах линейных кораблей. Например, в Ревеле, где находились воевавшие соединения — 1-я бригада крейсеров, часть Минной дивизии, Дивизия подводных лодок и ряд небольших кораблей, трагических эксцессов произошло значительно меньше. Известно также, что очень часто сами матросы вставали на защиту своих офицеров от убийц, приходивших «со стороны». Очень распространенной (думается, весьма небезосновательной) была версия о причастности к резне агентов германской разведки, особенно это касается убийства командующего Балтийским флотом вице-адмирала Непенина. Этой же версии придерживался и вышеупомянутый В.А. Белли: «В порту из-за угла в спину былубит командующий флотом вице- адмирал А.И. Непенин. Думаю, что этот акт был произведен агентом противника. А.И. Непенин был достаточно авторитетен и популярен в матросских массах, и поэтому вряд ли это убийство носило революционный характер». В официальной современной историографии принято считать, что Непенина убили анархисты, известно даже имя одного из убийц, оставивших свои воспоминания о страшном преступлении, это — матрос Береговой минной роты П.А. Грудачев. Но кто был «заказчиком» убийства? Точного ответа пока нет. Этим же вопросом задается и очевидец событий — лейтенант Б.В. Бьеркелунд, опубликовавший свои воспоминания в парижском журнале «Военная быль»: «Рассказывали, что убийца адмирала Непенина хвастался перед товарищами, что за свое дело он получил 25 тысяч. Из какой кассы они были выданы? Этот вопрос остался без ответа». Так или иначе, но произошедшие события, повлекшие огромное ослабление, а затем и развал флота, оказались весьма выгодны внешним противникам России.