В этот же период находившиеся в Ревеле флотские офицеры приняли участие в обороне города от большевиков в составе т. н. Ревельской самозащиты (формирования самообороны), а также в составе отдельных сухопутных частей. Например, в составе Балтийского ландесвера — добровольческого антибольшевистского формирования в Прибалтике — ротным командиром служил генерал-майор барон Ф.В. Раден, бывший капитан 1-го ранга Русского Императорского флота. Позже он командовал 17-м Либавским полком Северо-Западной армии и погиб 25 октября 1919 г. во время наступления на Петроград.
Зимой 1919 г. при штабе Северного корпуса сформировали военно-морской отдел, который возглавил капитан 1-го ранга М.Г. Кнюпфер. Впоследствии этот отдел был развернут в Военно-морское управление Северо-Западной армии, во главе которого стоял капитан 2-го ранга Д.Д. Тыртов. Общее командование и координацию действий немногочисленных морских частей Северо-Запада осуществлял начальник Морского походного штаба при Главнокомандующем — контр-адмирал В.К. Пилкин (с июля по декабрь 1919 г.). Деятельность управления заключалась в формировании морских частей — полка Андреевского флага, бронепоездов, танкового дивизиона и немногих кораблей, воевавших под русским военно-морским флагом (основные силы Балтийского флота находились в руках большевиков).
Полк Андреевского флага был сформирован летом 1919 г. В его составе находились все офицеры флота, не входившие в состав других морских частей, и около 400 матросов, перешедших на сторону белых во время мятежа на фортах Красная Горка и Серая Лошадь 13–17 июня 1919 г. Командовал полком капитан 1-го ранга С.С. Политовский. В начале августа во время отступления из-под Ямбурга одна рота полка, посланная на поддержку отступавших частей, оказалась окружена противником и прижата к берегу реки Луги. Половина ее личного состава погибла, другая половина попала в плен. Потеря этой роты, а также общее отступление армии послужили причиной расформирования полка.
Создание дивизиона бронепоездов произошло по двум причинам: захват большого количества подвижного состава в ходе майского наступления на Ямбург и необходимость его использования при продвижении вдоль железнодорожных магистралей, идущих в направлении на Гатчину и Псков. Из подручных средств, на базе обычных вагонов, а также с использованием двух броневагонов, захваченных солдатами Талабского полка у красноармейцев, удалось сформировать три морских бронепоезда — «Адмирал Колчак», «Адмирал Эссен» и «Талабчанин». Каждый бронепоезд вооружался 3-дюймовым полевым орудием и несколькими пулеметами. В состав поездов входили десантные отряды для действий вдоль железной дороги. Обслуживались бронепоезда морскими офицерами и, словно «броненосцы железных дорог», несли Андреевский флаг. Командовал дивизионом капитан 1-го ранга С.В. Ковалевский. Как писал участник Белою движения на Северо-Западе старший лейтенант Л.В. Камчатов: «