Однако в начале 2009 года происходит казус — детище пожирает своего создателя. Как и в случае с НСО, в "Северное Братство" в конце концов, попали не только монетизаторы политического процесса на коротком поводке у соответствующих органов, а идейные нацисты-подпольщики, принявшие разглагольствования Хомякова (которого в "Северном Братстве" называли просто — Пророк), за чистую монету.
И вопиющая беспринципность бывшего профессора, который, видимо, в ослеплении от блеска собственного величия, вёл переписку с представителем спецслужб Израиля о финансировании военного переворота(!), почему-то встала им поперёк горла.
1 января 2009 года Хомяков был с позором исключён из "Северного Братства". Исключение сопровождалось публикацией в Интернете целого ряда компрометирующих Хомякова документов. Далее началось некое действо, очень напоминающее "операцию прикрытия" провалившегося агента.
4 марта 2009 года чекисты арестовывают бывшего профессора, но арестовывают "очень небольно" — уже на следующий день его отпускают под подписку о невыезде.
Спустя полгода — в начале августа 2009 года — выясняется, почему. Хомяков, клеймящий в своих "бестселлерах" "антинародный режим" и его специальные службы, на поверку оказался очень мало похож на несгибаемого борца за идею. Так или иначе, но профессор Хомяков не нашёл ничего лучше, чем оговорить и представить крайними своих бывших сослуживцев по работе, с которыми они вместе трудились в ООО "Спецметропроект", а потом поругались на почве бизнес-интересов и разошлись.
Что интересно, говорят, будто уголовное дело против "Северного Братства" возбуждено по рапорту полковника Белоусова А.И. — начальника управления ФСБ по специальным объектам. Этот человек в конце 90-х вместе с Хомяковым работал в аналитическом центре при Академии ФСБ.
4 августа в 6 утра оперативники Следственного управления ФСБ вламываются в квартиру в подмосковном городе Железнодорожном, где проживали 33-летний предприниматель Антон Мухачев, его жена журналистка Ольга Касьяненко (на фото внизу) и их 6-месячная дочка Ярослава. На глазах у плачущего ребенка сотрудники избивают отца и угрожают пистолетом матери. Антона Мухачева арестовывают.
4 августа в Интернете появляются сообщения о "похищении" Хомякова, а чуть позже о том, что русский патриот Пётр Михайлович Хомяков в поисках спасения от третирующей его "кровавой гэбни" каким-то чудом сбежал на Украину, где намерен просить политического убежища. Однако и тут проявляется вопиющий непрофессионализм — поскольку в Киеве бывший профессор оказался уже в конце июля, но на суде по мере пресечения в отношении Антона Мухачёва были оглашены его показания.