Основными пунктами дислокации российской 4-й военной базы определены три военных городка, строительство которых было начато еще до войны, для размещения там российского и североосетинского миротворческих контингентов. Первая база, жилой городок № 47/1, расположена на северо-западной окраине Цхинвала. К началу войны он был почти завершен, но еще не имел внутренней отделки и подведенных коммуникаций. Во время войны стоявший пустым городок почти не пострадал, по нему не велось прицельного огня, на территорию было лишь несколько случайных попаданий ракет грузинских реактивных систем залпового огня и артиллерийских снарядов.
После войны активно продолжилось обустройство этого городка, и уже к февралю 2009 г. значительная часть новой базы была введена в эксплуатацию, включая казармы, жилые дома и социально-культурные объекты, боксы для части техники и вертолетную площадку. Обустройство базы под новые требования к ней активно продолжалось в 2009 г. Запланировано дополнительное строительство и на 2010 г. Крупным недостатком этого городка является то, что он находится всего в нескольких километрах от южноосетинско-грузинской границы, и в случае нового конфликта размещенный там российский личный состав и техника могут подвергнуться внезапному массированному артиллерийскому обстрелу из глубины грузинской территории.
Вторая российская база расположена в полутора километрах к западу от поселка Джава у поселка Угарданта. Помимо жилого городка № 47/2 там располагаются основные склады ракетно-артиллерийского вооружения и инженерной службы российских войск. Рядом с базой сразу после войны была оборудована вертолетная площадка с искусственным покрытием, пригодная для базирования 10–15 вертолетов. На площадке созданы запасы горюче-смазочных материалов и боеприпасов, позволяющие в случае необходимости оперативно перебросить туда дополнительные российские вертолеты и организовать их эффективное боевое применение непосредственно с территории Южной Осетии – возможность, которой очень не хватало войскам в первые дни войны.
Общей проблемой новых российских военных городков в Южной Осетии является их недостаточная вместимость, так как построенные для ограниченного миротворческого контингента, они не были рассчитаны на размещение там полнокровной мотострелковой бригады. В казармах пришлось производить «уплотнение», путем установки двухъярусных коек. Не были предусмотрены и боксы для бригадного комплекта боевой техники, многократно превосходящего по численности технику миротворческих контингентов. Проблема нехватки места была решена путем размещения около половины личного состава базы на территории 4-й военной базы в городе Владикавказе. Ротация персонала происходит раз в полгода.