В этот раз продвижение грузинских войск на всех направлениях проходило гораздо более медленно и осторожно, они подолгу задерживались, встречая укрепленные позиции и сопротивление южноосетинских сил. К 12.00 подразделения 2-й пехотной бригады легко заняли опустевшее село Хетагурово, оставленное передовым российским отрядом.
Утром 9 августа на протяжении всего нескольких часов российские ВВС потеряли сразу три боевых самолета. Около 9 часов утра над Сачхерским районом Грузии при выполнении боевого вылета грузинским комплексом ПВО был сбит дальний бомбардировщик Ту-22М3 из 52-го гвардейского тяжелого бомбардировочного полка из Шайковки. Два члена экипажа, майоры Нестеров и Прядкин, погибли, травмированный майор Малков был взят в плен грузинскими войсками, командир экипажа подполковник Ковенцов пропал без вести после катапультирования. Чуть позднее, около 10 часов, грузинским силам в районе Шиндиси огнем переносного ЗРК удалось сбить фронтовой бомбардировщик Су-24М из 923-го Государственного летно-испытательного центра в Ахтубинске, выполнявший вылет на подавление грузинской артиллерии. Экипаж катапультировался, но полковник Ржавитин погиб при приземлении. Раненый полковник Зинов попал в плен. Практически одновременно с ними над Цхинвалом был сбит (видимо, собственными войсками) и уже поврежденный при атаке грузинской колонны штурмовик Су-25СМ командира 368-го штурмового авиационного полка полковника Кобылаша. Ему удалось удачно катапультироваться над грузинскими селами Большого Лиахвского ущелья и выйти к своим войскам. Столь серьезные потери за столь малое время вынудили российское командование на 9 августа снизить интенсивность применения в боевых действиях авиации до анализа причин потерь. После потери Ту-22М3 до конца конфликта было приостановлено и участие дальней авиации в нем.
Отдельные вылеты российской штурмовой и бомбардировочной авиации тем не менее продолжались. В 11.30 при бомбардировке грузинской военной базы, расположенной в Гори, на улице Сухишвили, в результате авиационного удара и последовавшего пожара и взрыва склада боеприпасов, расположенного на территории базы отдельного танкового батальона, были серьезно повреждены три жилых пятиэтажных дома, находящихся по соседству с этим военным объектом. Этот инцидент стал наиболее крупной единовременной гибелью грузинских мирных жителей в ходе боевых действий, погибли 14 человек.
Около 13 часов грузинские боевые вертолеты Ми-24, пользуясь временным отсутствием в воздухе российской авиации, совершили боевой вылет и обстреляли из пулеметов и неуправляемыми ракетами позиции 4-го батальона министерства обороны Южной Осетии в районе села Гудзабар и асфальтового завода на окраине Цхинвала. Все вертолеты вернулись на базу под Каспи неповрежденными. Но и сам этот налет не нанес никакого ущерба южноосетинским или российским силам и не повлиял на ход боевых действий.