Лодка оснащена 6 торпедными аппаратами. Из них 2 аппарата рассчитаны на стрельбу телеуправляемыми торпедами новейшей конструкции с особо высоким коэффициентом поражения.
Для погрузки боезапаса на лодке установлено специальное устройство. Лодка может принять 18 торпед (6 – в торпедные аппараты и 12 – на стеллажи). Вместо торпед могут быть приняты 24 мины, 12 – в торпедные аппараты (по 2 на аппарат) и 12 – на стеллажи.
На лодках впервые установлено автоматическое устройство быстрого заряжания, которое в несколько раз сокращает время зарядки торпедных аппаратов, позволяет значительно увеличить скорострельность и обеспечить преимущество в дуэльной ситуации. Управление устройством быстрого заряжания осуществляется дистанционно из торпедного отсека с пульта управления «Мурена» или с местных постов.
Мощный комплекс минно-торпедного вооружения способен решать многоцелевые задачи. Он обеспечивает выстреливание всего боезапаса на всех глубинах погружения – от перископной до рабочей – и совместно с боевой информационно-управляющей системой (БИУС) позволяет вести как одиночную, так и залповую стрельбу по двум целям.
Взамен поста управления торпедной стрельбой «Ленинград», обеспечивавшего вручную на ПЛ проекта 641 ввод необходимых данных для производства торпедной стрельбы, на новой ДЭПЛ установлена БИУС – многоцелевой компьютер (МВУ- ПОЭМ). Он позволяет одновременно следить за 5 целями, из них 2 цели вести в автоматическом режиме и 3 – вручную, обеспечивая с комплексом телеуправления внесение поправок в связи с маневрами цели и точное наведение торпед на цель. БИУС позволяет решать целый ряд навигационных задач.
Малогабаритный навигационный комплекс «Андо- га» обеспечивает непрерывную прокладку курса, выдает координаты места и скорости. Через систему БИУС команда на изменение курса поступает на пульт управления ПЛ. То есть автоматика может вести лодку по проложенному курсу.
Лодка оборудована активной и пассивной радиолокационными станциями с высокой эффективностью слежения. Они могут четко работать в надводном и перископном положении.
Станция имеет систему расхождения целей и позволяет обнаружить надводные корабли, самолеты и вертолеты противника значительно раньше, чем те обнаружат лодку.
Архитектура носовой оконечности ПЛ позволила вписать в ее размеры гидроакустическую антенну совершенно новой конструкции, что помогло значительно увеличить дальность действия гидроакустического комплекса (ГАК). ГАК – МГК-400 спроектирован для нового поколения ДЭПЛ с учетом длительной эксплуатации в различных районах Мирового океана и возможностей модернизации по мере освоения новых технологий. Средства гидроакустики обеспечивают значительное увеличение дальности обнаружения целей и упреждения в дуэльной ситуации с вероятным противником. Все индикаторы систем выведены на единый пульт управления.