Кроме того, следует опасаться и неурожаев, как например, в 1998, когда урожай пшеницы снизился с 23,6 млн. тонн (1997 г.) до 16,2 млн. тонн. Другая опасность для населения состоит в загрязнении питьевой воды бактериями и сине-зелеными водорослями, из-за чего могут возникать эпидемии. Опасность возникновения эпидемии присутствует и в регионах, подвергшихся наводнениям.
В конце года люди в миллионных метрополиях Рио-де-Жанейро и Ла-Пас (La Paz) боролись с повышенной примерно на 6-10°C против среднего показателя температурой, а Панамский канал, напротив, страдал из-за необычного недостатка воды, так как пресные озера, из которых Панамский канал получает воду, пересохли (январь 1998 года). Из-за этого по каналу было возможно прохождение только небольших судов с малой осадкой.
Наряду с этими двумя самыми распространенными природными катастрофами, вызыванными воздействием Эль-Ниньо, в других регионах происходят и другие катастрофы. Так, Канаду тоже затрагивает воздействие Эль-Ниньо: заранее предсказывается теплая зима, так как это случалось в прежние годы Эль-Ниньо. В Мексике увеличивается число ураганов, которые возникают над водой теплее 27°C. Они беспрепятственно возникают над потеплевшей поверхностью воды, чего обычно не происходит или происходит очень редко. Так, ураган Полин осенью 1997 года нанес опустошительные разрушения.
Мексику, наряду с Калифорнией, также поражают сильнейшие бури. Они проявляются в виде ураганных ветров и долгих дождливых периодов, следствием которых могут быть возникновение грязевых потоков и наводнений.
Облака, приходящие с Тихого океана и содержащие большое количество осадков, выпадают в виде сильных дождей над западными Андами. В конце концов, они могут пересечь Анды в западном направлении и двигаться дальше к южно-американскому побережью. Этот процесс можно объяснить следующим образом:
Вследствие интенсивной инсоляции вода начинает сильно испаряться над теплой поверхностью воды, образуя облака. При дальнейшем испарении формируются огромные дождевые облака, которые легкий западный ветер гонит в нужном направлении и которые начинают выпадать в виде осадков над прибрежной полосой. Чем дальше облака продвигаются вглубь страны, тем меньше осадков они содержат, так что над засушливой частью страны осадки почти не выпадают. Таким образом, осадков в восточном направлении выпадает все меньше. Воздух приходит на восток из Южной Америки сухим и теплым, так что он в состоянии впитать в себя влагу. Это становится возможным потому, что при выпадении осадков освобождается большое количество энергии, которая была необходима при испарении и из-за которой воздух сильно нагревался. Таким образом, теплый и сухой воздух может с помощью инсоляции испарить оставшуюся влагу, из-за чего большая часть страны высыхает. Начинается засушливый период, связанный с неурожаями и недостатком воды.