После Отечественной войны Служба оказалась на хорошем счету у императора, который, хотя и не был в ее составе и практически не интересовался ее делами, не жалел средств на обеспечение, привлечение и обучение новых сотрудников и новые научные разработки. Однако в это же время среди молодых сотрудников Службы в очередной раз возникло движение с целью воздействия на политику государства, как внутреннюю, так и внешнюю. Возглавил это движение молодой, подающий надежды охотник Павел «Гусар» Пестель, которому удалось привлечь на свою сторону еще нескольких охотников, многих молодых защитников и научников. Результатом этого заговора стало выступление на Сенатской площади, которое едва не стало приговором для Службы в целом.
После неудачного восстания службу возглавил выдающийся защитник, граф Александр Христофорович Бенкендорф, хорошо зарекомендовавший себя еще во время войны с корсиканцем. Он пользовался большим уважением у молодого императора Николая I и сумел отстоять Службу, ее обособленный характер и практически весь объем финансирования. Именно под его руководством окончательно наладились связи с Папской Курией и Святой Инквизицией, а взаимодействие с Сипахами Пророка достигло таких высот, что во время антирусского восстания охотников бин Мухаммада бин Исмаила ал-Гимрави ад-Дагистани[73] и Шамиля[74] оба они были исключены из священных списков суфиев, Турция не оказывала им поддержки, а в конце концов тогдашний руководитель Сипахов приказал Шамилю сдаться, пригрозив в противном случае отлучить его и проклясть со всех минаретов.
В это время Служба получает новое название — Секретный Департамент III Отделения Собственной Е. И. В. Канцелярии. Этот период иногда именуют золотым веком Службы. Был разгромлен Варшавский Черный круг, включавший в себя двух высших вампиров, несколько десятков очень сильных болотников и уводней, кикимору, нескольких оборотней и многочисленную нечисть младших доменов. Им удалось подчинить себе большое количество людей, и в результате они подняли настоящее вооруженное восстание с целью взять под свой контроль Царство Польское. Была предотвращена попытка уничтожить Санкт-Петербург, наслав на него с помощью морской нечисти сильнейшие наводнения. Великий круг шаманов отказался от самостоятельной борьбы с нечистью, и его структуры органически вошли в состав Службы. К пропаганде борьбы с нечистыми были привлечены такие выдающиеся литераторы, как Пушкин, Жуковский, Аксаков, Булгарин (последний более известен как защитник Фаддей «Немец» Булгарин). Но особенно на этом поприще прославился великий охотник и исследователь нечисти Николай «Хома» Гоголь.