Изабель Юппер успешно играет и в театре. Среди театральных ролей самые лучшие это в театре «Одеон» в шекспировском спектакле «Мера за меру», а в театре «Эдуард VII» — в тургеневсной пьесе «Месяц в деревне», в ней Юппер играет Наталью Петровну — это ее старая любовь. Следует припомнить, что дипломной работой в Сорбонне была проза Льва Толстого. В 1989 году Юппер обратила внимание в томике Евгения Замятина на рассказ «Наводнение» и предложила живущему в Париже режиссеру Игорю Минаеву снять по нему фильм. В нем Юппер сыграла трудную роль Софьи, женщины, свершающей преступление в порыве ревности. Съемки велись в 1993 году в Москве, где актриса провела два месяца.
В кино Изабель Юппер снимается в основном во Франции, но ее часто приглашают за рубеж. Помимо России, она участвовала в съемках в Австралии (лента «Кактус»), Югославии («Черный Милан»), Италии («История Пьерры»), Германии («Малина»). Фильм «Малина» (1993) поставил немецкий режиссер Вернер Шрётер, в основе ленты — автобиографический роман Ингеборг Бахман — постоянной спутницы писателя Макса Фриша, которая была безумно влюблена в композитора Хенце. Героиня погибает от пожара: закурила в постели сигарету, загорелось белье, и пламя охватило дом. Полыхает спальня, полыхает безысходная страсть, которую великолепно передала на экране Изабель Юппер.
Фильм «Малина» в Германии имел большой успех, чего нельзя сказать о картинах, поставленных в Америке («Любитель», «Врата рая», «Бутон розы», «Окно спальни»). Элитарная актриса Изабель Юппер не очень вписывается в голливудские каноны, не вышел и дуэт Юппер с Микки Рурком — это разные актерские вселенные. Зато великолепно выглядела Юппер в «Бесах» Достоевского у Анджея Вайды — в роли Марии Шатовой. И у итальянского режиссера Науро Болоньини «Подлинная история дамы с камелиями» (1980) — в киноверсии по роману Александра Дюма-сына. Образ Альфонсины Дюплесси (прообраз Маргариты Готье) Юппер наполнила своей печальной красотой, трагическим ощущением мира, стремлением к недостижимому идеалу.
Из поздних работ Изабель Юппер выделим три: «Церемонию» (1995), «Пианистку» (2001) и «8 женщин» (2002). В «Церемонии» Клода Шаброля Юппер играет неказистую и одинокую почтальоншу Жанну, которая со своей новой знакомой, служанкой Софи (актриса Сандрин Боннэр) совершает, вроде бы, немотивированное преступление. Они убивают хозяев Софи. Убивают буднично и бесстрастно, и это даже не месть «униженных и оскорбленных», а нечто другое: пустота сердец и ненависть к чужому и незнакомому: хозяева обожали Моцарта, и эта любовь двум преступницам из народа была непонятна и неприятна. В «Церемонии» Изабель Юппер безжалостна к своей героине. Ее Жанна вероломна и коварна.