В соответствии с дзогчен, энергосистема человека в процессе его жизни проходит через две основные фазы: физическую и метафизическую. Этим двум фазам соответствуют три типа сознания.
Физическая фаза. Энергетическая схема представлена Большим и Малым энергетическими кругами, которые замыкаются в незамкнутый контур, идущий по передней и задней средней линиям тела. Эти линии соответствуют двум экстраординарным энергетическим каналам — ду май и жень май. Большой круг образован 12 меридианами 6ти полых и 6ти плотных органов. Малый круг образован 5тью главными органами — сердце, печень, почки, селезенка, легкие. За нормальную работу Большого и Малого кругов отвечает меридиан тройного обогревателя, который имеет три энергетические центра, располагающиеся на позвоночнике. Верхний обогреватель — 7й шейный позвонок, Средний обогреватель — 5й грудной позвонок, Нижний обогреватель — 5й поясничный позвонок. Все три центра работают на подсознательном уровне, обеспечивая автоматизм энергообмена. Если этот автоматизм нарушается, то человек заболевает и умирает. Уровень сознания человека соответствует уровню «животной души». Животная душа примитивна и «работает» на уровне удовлетворения физиологических потребностей организма. Еда, секс, сон и защита — основные функции животной души. Между каналами Большого и Малого кругов образуются коллатерали или Ло-каналы, которые обеспечивают дополнительные взаимосвязи.
Мышление или сознание животной души стоит на уровне абсолютного отрицания, которое выражается в виде формулы: «Я — не есть Это Все, но Все Это — МОЕ». «Я — не есть это дерево, но оно мне принадлежит». Человек отгораживает, отделяет себя от окружающего мира, делит его на плюс и минус, плохое и хорошее, проводит границы и запреты. При этом стремится захватить побольше всего, что попалось ему на глаза. Он верит, что смерть — это конец, предел, за которым ничего не существует. Поэтому «от жизни надо брать все». «Радуйся, пока молодой», «На наш век хватит», «После меня (нас) хоть потоп». В погоне за удовлетворением своих желаний и потребностей, животная душа готова убить любого, кто ему помешает, уничтожить и продать все, чтобы достичь цели. «Цель оправдывает средства» — говорит она.
Животная душа стремится отхватить как можно больше, а затем огородиться, чтобы защитить свое добро.
Однако в процессе жизни животная душа вынуждена играть по правилам общества, в котором она живет и вынуждена сдерживать свои инстинкты и желания. Те, кто себя не сдерживают, становятся отщепенцами — бандитами, ворами, убийцами, становятся вне закона. Религия животной души — примитивный материализм. Если это Бог, то только карающий и милующий. Божество животной души работает по принципу меновой торговли — когда ему приносят угодную жертву, Оно дарует милость и исполняет желание, когда жертвы нет — Оно гневается и обрушивает свой гнев на людей.