Суровым экзаменом для народов нашей страны и для чекистов явилась Великая Отечественная война. В предвоенные годы партия поставила задачи по выявлению агрессивных планов фашистских государств и по пресечению шпионских действий их разведок. В 1940 году и в первой половине 1941-го органами государственной безопасности страны обезврежены тысячи вражеских агентов. По признанию западногерманского историка П. Карелла, Германия, вплоть до нападения на СССР, мало знала о военных секретах России.
Беспредельно преданные делу Коммунистической партии, чекисты вместе с Вооруженными Силами и всем советским народом мужественно сражались с фашистскими захватчиками, проявляя высокое профессиональное мастерство, несгибаемую стойкость и бесстрашие. Не дрогнув, вступили в неравный бой с фашистским десантом на Ростовском железнодорожном вокзале 20 ноября 1941 года сотрудники областного Управления НКВД Федор Афанасьевич Кулаев, Арам Аршакович Башмахчиев, Николай Иванович Семыкин, Антон Никитич Чернявцев и Николай Мефодьевич Синельников. Не могли они допустить, чтобы враг глумился над больными и ранеными красноармейцами, топтал улицы родного города. Их героическая гибель служит ярким примером беззаветной преданности чекистов своему народу.
С приближением гитлеровских войск к Ростову донские чекисты под непосредственным руководством областного комитета партии приступили к формированию партизанских отрядов из числа местного населения. В конце 1941 — начале 1942 года в оккупированных немцами Неклиновском, Азовском и Таганрогском районах некоторые из партизанских отрядов успешно провели ряд операций против вражеских войск.
Встреча молодых чекистов с руководством и ветеранами Управления КГБ.
Опираясь на помощь советских патриотов, чекисты Управления НКВД наладили переброску разведывательных групп в тыл врага. В холодные зимние ночи 1942-го нашим разведчикам, с риском для жизни, не раз приходилось делать опасные переходы по льду Азовского моря из Ростова в Таганрог и тем же путем возвращаться. Добытые ими сведения оказывались очень важными для советского командования. При выполнении заданий в Таганроге героически погибли советские разведчики — М. Я. Талпа и его сын Андрей, Н. И. Козубко.
Среди граждан, однако, нашлись отщепенцы, помогавшие фашистам выявлять, выслеживать и уничтожать советских людей, с оружием в руках боровшихся против оккупантов. Только в городе Шахты оккупанты с помощью предателей расстреляли более 3,5 тысячи советских патриотов-коммунистов, комсомольцев активистов и сбросили их в шурф шахты имени Красина.