Японская авиация полностью контролировало небо над Манильской бухтой, поэтому мы не могли перебрасывать подкрепления морем. В-17, действующие с Минданао, были быстро уничтожены. 21 декабря контр-адмирал Фрэнсис У. Рокуэлл, командующий 17 Военно-морским районом, перенес свой штаб в тоннель на острове Коррехидор. Накануне Рождества генерал МакАртур решил оставить Манилу (японцы бомбили ее ежедневно) и развернуть свою армию на последнем оборонительном рубеже — на полуострове Батаан. Адмирал Харт приказа 2 оставшимся эсминцам уходить из Манильской бухты на Яву, где контр-адмирал Уильям Э. Глассфорд руководил действиями Азиатского флота. Сам Харт отбыл на следующий день после Рождества на подводной лодке «Шарк», оставив обреченные на уничтожение плавбазу «Канопус», тральщики, канонерки и торпедные катера под командование Рокуэлла. Они погибли, прикрывая фланги армейских позиций во время упорной обороны Батаана.
Примеров личной храбрости хватало. Капитан 2 ранга Фрэнсис Дж. Бриджет, потеряв свою эскадрилью PBY, сформировал сводный морской батальон примерно из 200 авиатехников, морских пехотинцев, филиппинцев и всех, кто пожелал к нему присоединиться. Перекрасив свою белую морскую форму в желтый цвет, эти отчаянные парни отбивали попытки японского десанта, в несколько раз превосходящего их численностью, захватить штаб МакАртура в Маривелесе и даже вынудили группу японцев искать укрытия в пещерах на береговом обрыве, где их перебили пулеметы торпедных катеров лейтенанта Джона Д. Бакли. 21 февраля 1942 подводная лодка «Суордфиш» вывезла президента Филиппин Кесона. 11 марта по приказу из Вашингтона торпедный катер лейтенанта Бакли вывез генерала МакАртура и адмирала Рокуэлла на Минданао, откуда они на В-17 улетели в Австралию.
Генерал Джонатан М. Уэйнрайт принял командование армией, которая 8 апреля отступила в Батаана на Коррехидор. «Скалу» отважно обороняли 4 полк морской пехоты полковника С.Л. Хоуарда и остатки армейских частей. Они продержались еще месяц. Наконец 6 мая пришло горькое известие, что генерал Уэйнрайт, надеясь предотвратить бессмысленное кровопролитие, сдал Коррехидор и все войска противнику.
Это была самая крупная капитуляция в американской истории, не исключая Аппоматокс. Но если там рассеялась мечта южан о собственной империи, Коррехидор только укрепил желание МакАртура вернуться. И страна увидела, как он вернулся во главе армии, которая продиктовала противнику свои условия. Родились новые узы братства между американцами и филиппинцами, которые больше не разъединялись.