В 1898 году В. И. Вернадский был назначен профессором Московского университета, где и работал до 1911 года. За двадцатилетний период работы в Московском университете он создал учебники по минералогии и кристаллографии, в корне перестроил преподавание этих дисциплин.
В 1906 году В. И. Вернадский был избран адъюнктом Академии наук, а в 1909 году — академиком. В 1911 году он оставил Московский университет и переехал в Петербург.
С тех пор по день смерти его научная деятельность протекала преимущественно в Академии наук.
Научная деятельность В. И. Вернадского по исследованию минералов и химических элементов Земли может быть условно разделена на три периода. В первый период ученый занижался минералогией и кристаллографией. Во второй, на основе огромных материалов минералогии, создает науку геохимию. Ь третий (это последние 15–20 лет жизни) В. И. Вернадский Нецело занят вопросами биохимии.
Ученые до В. И. Вернадского преимущественно изучали минералы с точки зрения их внешних свойств — формы, цвета, твердости, размера и т. п. Очень мало внимания уделялось выяснению причин и условий образования минералов, их взаимодействию друг с другом, а также их внутренним свойствам, их строению.
В. И. Вернадский умел находить в минералах огромное количество сокрытой информации о том, что происходит внутри Земли. Это было огромным шагом вперед. Учефный с успехом искал и находил причины процессов минералообразова- ния и изучал сам эти процессы. «Я положил в основу широкое изучение минералогических процессов земной коры, обращая основное внимание на процесс, а не только на исследование продукта процесса (минерала), на динамическое изучение процессов, а не только на статическое изучение их продуктов, причем, — после некоторых колебаний, — остановился для своей исследовательской работы главным образом на минералогии, а не на кристаллографии».
В. И. Вернадский дал наиболее полное и правильное определение минералогии как науки и минерала как предмета исследования этой дисциплины. Он писал: «Минералогия представляет собой химию земной коры, она имеет задачей изучение как продуктов природных химических процессов, так называемых минералов, так и самих процессов. Она изучает изменение продуктов и процессов во времени, в различных естественных областях земной коры».
Обобщив огромный фактический материал по минералам, В. И. Вернадский разработал и выдвинул свою теорию, которую впоследствии знаменитый французский химик Лешателье назвал гениальной.
Современные исследования подтвердили основные положения теории В. И. Вернадского и тем самым показали, что научная мысль минералогов и кристаллохимиков благодаря его трудам, благодаря его поразительной силе научного предвидения шла правильным путем. Благодаря работам Владимира Ивановича Вернадского минералогия, содержащая бесчисленное количество разрозненных фактов, превратилась в подлинную науку.