После смерти своего отца, Ахмед правил этой частью ханства-Или, Юлдуз и Турфанским княжеством-вплоть до своей смерти (1486-1503). Наслаждаясь этой степной жизнью, он с успехом воевал против Ойратов или Калмыков с одной стороны, против Киргиз-Казахов, с другой. Тарихи Рашиди отмечает, что Ойраты ему дали уважительное имя Алаша "Убийца". [1330]
К 1499 году он отобрал у эмира из семейства Дуглат-Абу Бакра Кашгар и Янги-Гиссар. Внутри своих владений этот энергичный Чингизханид осуществил целый ряд мероприятий и сурово наказал лидеров восставших племен.
Китайская историческая хроника Мин-ши говорит о вступлении Ахмеда – "А-ха-ма, султан Турфана" – в оазис Ха-ми. Ха-ми был захвачен в 1482 г. у Чагатайского ханства туземным принцем Ха-шеном, наследником местной династии киданей, которая поддерживалась Китаем. В 1488 г. Ахмед убил Ха-шена из засады и овладел страной. На следующий год ставленники китайцев вновь захватили Ха-ми. В 1493 г. Ахмед захватил в плен правителя Ха-ми и китайского представителя. Китай ответил закрытием границ перед караванами, идущими из Турфана и высылкой из Кан-су коммерсантов, родом из Уйгурии. В результате, как отмечается в Мин-ши, из-за недовольства, возникшего в стране уйгуров и чагатаев против Ахмеда, он вынужден был оставить Ха-ми во власти местной династии, то есть под китайским влиянием.
Отступление Чагатаидов на восток Тянь-Шаня. Влияние возрождения Тимуридов в Кашгарии. Историк Хайдар-мирза
В то время как Ахмед правил в Аксу и в Турфане, на территории восточного Моголистана и Уйгуристана (1486-1503), его старший брат Махмуд наследовал у своего отца Юнуса Ташкент и западный Моголистан (1487-1508). Последние Тимуриды Самарканда, как мы видели, пытались забрать Ташкент у Махмуда, однако они были разбиты им недалеко от этого города, на реке Чир или Парак, и Ташкент остался резиденцией монгольских ханов (1488). [1331]
К несчастью, Махмуд допустил серьезную ошибку, приняв знаменитого Мухаммеда Шейбани, чтобы уменьшить его авантюрную роль, и который, занес свой меч над диспозицией хана. [1332]
Довольный его заслугами, Махмуд дал ему в управление город Туркестан (с 1487 по 1493 год). [1333]
С помощью, которую слишком доверчивый Махмуд ему оказал, Мухаммед Шейбани отбил, как мы видели, у последних Тимуридов Бухару и Самарканд, и стал правителем Трансоксианы (1500). Махмуд затем пожалел о своей доброжелательности. Став властелином Трансоксианы, Мухаммед Шейбани повернул против него. Махмуд обратился за помощью к своему брату Ахмеду, который приехал к нему из Уйгурии в Ташкент, однако Шейбани разбил и взял в плен обеих братьев в битве при Ахси, на северо-востоке Коканда, в Фергане. Он обращался с ними в этот раз, как мы уже видели, с почтением, не без подтрунивания над наивностью Махмуда, при котором он сделал карьеру, и достаточно скоро освободил их (15021503), сохранив, однако, Ташкент и Сайрам. Ахмед умер в скором времени от паралича в Аксу (зима 1503-1504 года). Что касается Махмуда, он допустил глупость попасть снова в руки Мухаммеда Шейбани, который, в этот раз, обрек его на смерть недалеко от Ходжента (1508-1509).